《Molecular Plant Pathology》:Assessing Zymoseptoria tritici Candidate Effectors in the Non-Host Nicotiana benthamiana Reveals Immune Recognition and Potential Host-Independent Activities
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Zymoseptoria tritici是引起小麦壳针孢叶枯病(Septoria tritici blotch, STB)的重要小麦病原菌。尽管其具有经济影响,但对Z. tritici与其宿主之间分子互作的理解仍然有限,尤其是许多未表征候选效应子的功能。在此,
Zymoseptoria tritici是引起小麦壳针孢叶枯病(Septoria tritici blotch, STB)的重要小麦病原菌。尽管其具有经济影响,但对Z. tritici与其宿主之间分子互作的理解仍然有限,尤其是许多未表征候选效应子的功能。在此,研究人员通过在本氏烟草(Nicotiana benthamiana)这一异源非宿主系统中瞬时表达,评估了在早期活体营养阶段和向死体营养转变阶段表达升高的7个Z. tritici候选效应子,并比较了是否携带其预测信号肽。AlphaFold结构预测显示,其中两个候选效应子与已知功能蛋白具有相似性:一个来自酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的甾醇结合蛋白,以及一个来自苹果腐烂病菌(Valsa mali)的坏死诱导效应子。效应子相关表型并非总是与表达时程相关,且信号肽的存在显著影响所观察到的活性。由于N. benthamiana并非Z. tritici的天然宿主,观察到的响应可能反映效应子的保守、宿主非依赖性活性或N. benthamiana的免疫识别,而非其在小麦中的天然功能。与此区分一致的是,两个候选效应子Mycgr3107904和Mycgr394290在N. benthamiana中诱导细胞死亡,同时调节活性氧(reactive oxygen species, ROS)爆发,可能表明免疫识别。一些候选效应子减弱ROS产生,提示可能靶向保守的细胞过程,而没有一个抑制PBR1介导的细胞死亡。总体而言,研究人员的结果表明,候选效应子的活性不能仅从表达谱推断,非宿主N. benthamiana系统中的响应反映了免疫识别和潜在保守活性的组合,主要用于在天然小麦–Z. tritici互作中优先选择候选效应子进行验证。
小麦病原真菌Zymoseptoria tritici引起的壳针孢叶枯病(Septoria tritici blotch, STB)是影响小麦生产的重要病害之一。尽管该病害经济影响重大,但Z. tritici与宿主间的分子互作机制仍所知甚少,特别是许多未被表征的候选效应子(effector)的功能。效应子通常为小分泌蛋白,通过调节宿主免疫促进侵染。已有研究利用异源非宿主植物本氏烟草(Nicotiana benthamiana)筛选效应子,但观察到响应可能不等同于其天然宿主功能。为了解析候选效应子的潜在功能,研究人员从感染感病小麦的RNA-seq数据中选取了7个在早期活体营养阶段及向死体营养转变阶段高表达的候选效应子,在N. benthamiana中瞬时表达,并比较有无信号肽对活性的影响;同时结合AlphaFold结构预测寻找功能线索。研究发现,部分候选效应子的活性与表达时程不一致,信号肽的存在显著影响ROS调节能力;Mycgr3107904和Mycgr394290可诱导细胞死亡,而无效应子抑制PBR1介导的细胞死亡。这些结果提示,非宿主系统中的响应包含免疫识别和保守活性,可用于优先选择候选效应子进行小麦上的验证。
主要技术方法包括:从已发表数据集(Gomez-Gutierrez et al. 2025,感病小麦品种)筛选差异表达候选效应子,经SignalP等预测信号肽后选7个;利用tBLASTx/BLASTp在18个Z. tritici分离株和3个姐妹种中分析保守性;采用AlphaFold v3.0预测结构,并与FoldSeek和DALI数据库比对;通过农杆菌介导在N. benthamiana中瞬时表达,进行几丁质诱导的ROS测定、坏死诱导试验及PBR1(D496V)细胞死亡抑制试验。
2.1 候选效应子的保守性:通过序列比对,发现大多数候选效应子在Z. tritici分离株中高度保守(>90%),而在姐妹种中一致性较低(约75%),且有些效应子在特定分离株中缺失或发生基因破坏,如Mycgr394290仅在欧洲分离株3D7、1A5和1E4中编码约60个氨基酸的截短蛋白。
2.2 AlphaFold结构预测:结构比对显示,Mycgr3111221和Mycgr3105487与F. fulva的LysM效应子Ecp6结构相似;Mycgr3109710与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的甾醇结合蛋白PRY1相似;Mycgr3107904与苹果腐烂病菌(Valsa mali)坏死诱导因子VmHEP1(Hce2域)相似。这些相似性为功能推测提供了依据。
2.3 信号肽影响几丁质诱导的ROS调节:在N. benthamiana中,无信号肽时Mycgr394290和Mycgr3107904显著抑制ROS;有信号肽时,Mycgr3109710、Mycgr3103393和Mycgr3107904显著抑制ROS,而Mycgr394290则反而增加ROS(但未达显著)。这表明信号肽对于效应子功能至关重要。
2.4 无效应子抑制PBR1诱导的细胞死亡:利用DEX诱导的PBR1(D496V)自激活系统,与各效应子共表达,1天后观察细胞死亡,结果所有测试效应子均不能抑制PBR1介导的细胞死亡,说明它们不作用于该NLR或其下游信号。
2.5 两个候选效应子诱导细胞死亡:在N. benthamiana叶片中,Mycgr3107904和Mycgr394290在6天(dpi)后诱导明显细胞死亡,而对照无此现象。Mycgr3107904含Hce2域,与坏死诱导功能一致;Mycgr394290的ROS增加趋势支持其促进细胞死亡的可能。
讨论部分指出,结构预测中多数效应子N端和C端为低置信度区域,可能为内在无序区。信号肽影响功能这一结果得到验证。由于N. benthamiana并非Z. tritici天然宿主,观察到的ROS抑制和细胞死亡可能是保守的宿主非依赖活性,也可能被N. benthamiana免疫受体识别。研究存在局限性,如未分离质外体验证分泌,且非宿主受体库与小麦不同。未来需在天然宿主(小麦)中验证这些效应子的功能。
结论:候选效应子的活性不能仅从表达谱推断;非宿主N. benthamiana系统观察到的响应是免疫识别与潜在保守活性的组合,其意义在于优先筛选需要在小麦–Z. tritici互作中进一步验证的候选效应子。