棕榈酰化相关基因标签预测卵巢癌预后：ACSM3通过与HSPD1协同限制脂质积累抑制肿瘤进展

《Cellular Oncology》：Palmitoylation-related ACSM3 suppresses ovarian cancer progression via interacting with HSPD1 and regulating lipid metabolism

　　

摘要

背景

棕榈酰化相关基因在肿瘤进展中发挥关键作用，但其在卵巢癌（OC）中的预后及治疗意义尚不明确。本研究利用机器学习，旨在开发一种棕榈酰化相关基因标签，以预测卵巢癌的结局并指导治疗策略。

方法

分析了来自TCGA和GTEx的基因表达数据，以鉴定差异表达的棕榈酰化相关基因。利用跨多个队列的101种机器学习算法组合，我们构建了一个预后标签。对核心基因ACSM3在卵巢癌进展中的功能和机制进行了研究。

结果

一个五基因预后模型（ACSM3、GRB7、DPM3、TRPV4、DNAJA1）将卵巢癌患者分为高风险组和低风险组，两组的总体生存率存在显著差异。ACSM3在卵巢癌组织和细胞中表达下调，其低表达与不良预后相关。ACSM3过表达抑制了增殖，诱导G1期阻滞，促进凋亡，并抑制了肿瘤生长。在机制上，ACSM3减少了脂质积累，而其敲低则上调了铁死亡负调控因子。ACSM3与HSPD1相互作用，HSPD1可能在翻译后水平调控ACSM3。敲低HSPD1减弱了ACSM3的抗增殖和降脂作用。

结论

本研究建立了一个稳健的卵巢癌棕榈酰化相关预后标签，并鉴定ACSM3为一种肿瘤抑制因子，其通过与HSPD1协同作用限制脂质积累来抑制卵巢癌进展，为未来的治疗策略奠定了基础。