胎盘性染色体DNA甲基化与早发型子痫前期的关联研究

《Biology of Sex Differences》：Sex-linked placental DNA methylation associated with early-onset preeclampsia

摘要

背景

胎盘形成受损和胎盘功能障碍是早发型子痫前期（EOPE）的驱动因素，然而我们对胎盘病理学背后的分子变化的理解尚不完整。DNA甲基化（DNAme）是用于识别与EOPE相关的分子模式的工具之一；然而，之前的研究仅检查了常染色体上与EOPE相关的DNAme。这是第一项识别性染色体相关EOPE DNAme的研究。

方法

分析了来自公共数据集的843个胎盘（XX = 386，XY = 457）的DNAme芯片数据（450K和EPICv1芯片）。我们识别了EOPE（n = 63）和非子痫前期早产（n = 71）之间的X和Y染色体DNAme差异。我们还使用所有样本（n = 843）识别了与eoPRED评分（一种基于DNAme的EOPE相关胎盘病理评分）相关的性染色体DNAme。性染色体DNAme的线性建模按性别分层，并使用交互检验来确定显著结果是否具有性别特异性。

结果

我们在各个数据集/芯片平台中识别出大量与EOPE相关的性连锁差异甲基化胞嘧啶（DMCs），并发现了15个跨芯片平台存在的高置信度和高效应关联。在XY样本中识别出的X染色体EOPE DMCs多于XX样本，但在经过与性别的交互检验后，大多数关联并不具有性别特异性。无论使用EOPE的临床诊断还是eoPRED评分，我们都观察到相似的关联；然而，使用eoPRED评分识别出的DMCs更多。

结论

这是第一项评估EOPE中胎盘X和Y染色体DNAme的研究。我们在性染色体上观察到显著发现，包括可能与EOPE病理生理学相关的基因，如ACE2、MBLN3和MIR503HG。