快速全基因组测序在产前诊断中的临床应用效率与围产期管理影响评估

《Human Genomics》：Clinical utility of rapid whole-genome sequencing for prenatal diagnosis of fetal structural anomalies: a prospective multicenter cohort study in China

摘要

背景

胎儿结构异常在妊娠中的发生率为2-3%，是进行产前基因检测的主要指徵。在这种情况下，临床应用的效率关键取决于检测结果返回的时间（TAT），因为管理决策必须在较短的妊娠窗口期内做出。尽管之前的产前基因组测序研究主要集中在诊断效率和数据分析验证上，但关于其在实际应用中的效果以及对临床管理的影响的证据仍然有限。这项前瞻性多中心研究评估了快速全基因组测序（rWGS）在产前诊断中的临床应用效率、检测结果返回时间以及其对临床管理的影响。

结果

在中国七个中心对176名胎儿进行了检测，其中三联体rWGS被作为一级诊断工具使用，总体上实现了29.0%（51/176）的分子诊断率，包括染色体非整倍性、拷贝数变异（CNVs）、结构变异（SVs）、单基因单核苷酸变异以及插入/缺失（SNVs/indels）。检测结果返回的中位时间为10天（范围7-12天），显著快于产前外显子测序（中位时间17天；n=94；P<0.001）。rWGS的结果为139例（79.0%）的围产期管理提供了依据，包括是否继续妊娠的决策、阳性结果带来的可操作性产后管理建议，以及阴性结果所带来的安心。值得注意的是，在104个获得阴性结果的家庭中，有52个家庭选择继续妊娠；其中10名新生儿随后接受了成功的手术矫正。在39例妊娠晚期出现症状或病情进展的病例中——28例（71.8%）在中期的超声检查结果完全正常，11例（28.2%）在早期有轻微异常但病情逐渐发展——rWGS的诊断率为28.2%，与整个队列的29.0%相当。

结论

在这项多中心研究中，rWGS提供了及时、全面的基因组诊断结果，并能够捕捉到胎儿逐渐发展的、症状显现较晚的异常情况。这些发现突显了胎儿遗传疾病的动态特性，支持进行连续监测，而不仅仅依赖单次超声检查。凭借10天的检测结果返回时间以及具有临床意义的阳性及阴性结果，rWGS有助于及时决策、围产期管理和生育计划。