基于单细胞与空间转录组构建乳腺癌间质细胞高分辨率图谱

《npj Precision Oncology》：Integration of single-cell and spatial transcriptomics reveals stromal cell features in breast cancer

摘要

间质细胞是乳腺癌肿瘤微环境的关键组成部分，然而它们的异质性、空间组织结构以及与肿瘤细胞和免疫细胞的相互作用尚未完全明确。我们整合了来自349名患者的233,518个非免疫性间质细胞的单细胞RNA测序数据，以及51名患者的空间转录组数据。这项分析发现了36种具有不同转录程序、空间分布和功能特征的成纤维细胞、内皮细胞和壁细胞亚群。ABCA8⁺脂质相关成纤维细胞存在于肿瘤边缘，显示出与恶性细胞的相互作用，并与T细胞耗竭相关的表型相关。CCL19⁺炎症性成纤维细胞表现出与三级淋巴组织形成相关的空间模式，而肿瘤相关的外周细胞则显示出与PGF⁺顶端内皮细胞的相互作用，这些相互作用可能参与细胞外基质的沉积和血管重塑。这些发现共同构建了一个高分辨率的乳腺癌间质图谱，揭示了间质亚型、空间背景及潜在的细胞间通讯机制。这一资源为研究间质细胞在肿瘤进展和免疫调节中的作用提供了框架，不过仍需进一步的实验验证。