基于 Seahorse 技术的儿童肿瘤代谢监测实验方案与指南

《npj Precision Oncology》：Protocols for identification and assessment of bioenergetic differences in diverse pediatric cancer specimens

摘要

在癌症中，新陈代谢经常发生改变（例如瓦尔堡效应，即倾向于过度依赖糖酵解而忽视氧化磷酸化）。治疗（如化疗）和营养因素都可能对癌症组织和健康组织的新陈代谢产生不同的影响。监测癌症样本及治疗过程中的代谢失调在技术上具有挑战性，尤其是对于那些罕见、多样且代谢特征难以确定的肿瘤，如儿童来源的肿瘤。然而，这可能在改善癌症治疗方面具有重要的临床应用价值。在此，我们制定了一套详细的实验方案，使用Seahorse细胞分析仪来研究儿童癌症患者细胞、类器官、器官型组织切片以及原发性样本的功能性生物能量代谢。我们提供了七份应用说明，以展示在二维和三维患者样本中监测代谢异质性和药物反应的可能性。同时，我们也提出了若干潜在的问题解决方法，以提高数据的一致性和可靠性。