全球首份呼吸道宏基因组测序临床报告共识指南

《Communications Medicine》：Reporting and interpretation of respiratory metagenomic results in clinical practice: a systematic review and consensus guidelines from the UK NHS Respiratory Metagenomics Network

摘要

宏基因组测序可以直接从呼吸道样本中识别病原体，而无需进行培养，但不同实验室在结果的解释和报告方式上存在很大差异。在这份全球首份共识性指南中，我们总结了当前的实践情况，并指出了知识上的空白。通过对文献的回顾，我们发现了53项涉及6000多名参与者的研究，发现现有证据受到方法不一致、偏倚风险以及主观解释的影响而受到限制。经过专家研讨会以及英国国家医疗服务体系（NHS）呼吸系统宏基因组网络内六个地点的三轮德尔菲讨论后，19位专家就28项建议达成了一致。该指南提出了明确的实用原则，包括如何确定检测阈值、使用对照样本来识别污染情况、决定哪些发现需要报告，以及评估检测到的微生物是否具有临床意义。此外，指南还提供了一个用于报告呼吸道宏基因组结果的决策辅助工具。这些建议旨在促进更加透明和一致的临床报告，同时明确验证工作和未来研究的重点方向。