《Molecules》:Design and Synthesis of New Derivatives of Alkaloid Lupinine: Structural Characterization, Acetylcholinesterase Inhibition Evaluation, and Molecular Modeling Study
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植物生物碱在药物开发研究中备受关注。芦宁碱(lupinine)因其可得性与生物活性而成为值得研究的生物碱;尽管已有若干芦宁碱衍生物被报道具有特定生物活性,但如何设计合成对额外药理靶点具有高特异性的新型衍生物仍是持续挑战。本文描述以芦宁碱衍生物作为乙酰胆碱酯酶(
植物生物碱在药物开发研究中备受关注。芦宁碱(lupinine)因其可得性与生物活性而成为值得研究的生物碱;尽管已有若干芦宁碱衍生物被报道具有特定生物活性,但如何设计合成对额外药理靶点具有高特异性的新型衍生物仍是持续挑战。本文描述以芦宁碱衍生物作为乙酰胆碱酯酶(AChE)抑制剂的合成研究。研究人员提出并实施了两条合成新化合物的路线(产率71–90%):芦宁叠氮与一系列丙-2-炔基及乙炔基取代生物碱衍生物的CuAAC反应,以及1-((丙-2-炔氧基)甲基)八氢-1H-喹嗪、甲醛与仲胺参与的铜催化一锅三组分反应(A3-偶联)。采用Ellman法评价新化合物生物活性;结果表明多数合成物质在体外对AChE具良好或中等抑制活性。含芦宁碱与黄嘌呤片段(茶碱、咖啡因)11、12或秋水仙碱15,以及双芦宁碱衍生物16,对AChE抑制活性最高,IC50分别为0.47、0.035、1.3与1.4 μM。结合构象与同步相互作用模式通过分子对接研究进一步阐明。
研究背景与问题提出
神经退行性疾病阿尔茨海默病(Alzheimer’s Disease,AD)的病理过程具有多因子特征,包括β-淀粉样蛋白聚集、氧化应激、突触功能障碍、tau蛋白过度磷酸化、神经炎症与胆碱能失调。其中乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AChE)抑制可减缓乙酰胆碱降解,是临床相关干预路径。喹嗪里西啶(quinolizidine)类生物碱中,芦宁碱(lupinine)因低毒、低遗传毒性及骨架易修饰而具药物化学价值;但其已有衍生物对AD相关靶点的特异性仍有限,亟需设计兼具多靶点属性的新型杂合分子。
研究概述与意义
研究人员以芦宁碱为母核,引入1,2,3-三唑药效团与炔丙基胺片段,分别通过铜催化叠氮-炔环加成(CuAAC)与A3-偶联,将芦宁碱与黄嘌呤、毒芹碱类生物碱、金雀花碱、秋水仙碱等天然生物碱连接,构建系列杂合衍生物,并系统评价其AChE抑制活性与结合模式。结果显示多个化合物优于加兰他敏,其中咖啡因-芦宁碱杂合体12达纳摩尔级抑制(IC50=0.035 μM),接近多奈哌齐。该工作为AD多靶点先导物提供了可拓展的合成策略与结构活性依据。
主要关键技术方法
研究人员采用两类铜催化反应实现骨架构建:CuAAC用于叠氮与端炔生成1,2,3-三唑连接双生物碱;A3-偶联用于炔、甲醛与仲胺一锅生成炔氧甲基取代喹嗪衍生物。生物活性以电鳗AChE为酶源,通过Ellman比色法测定IC50。结合模式借助人源AChE晶体结构(PDB ID: 4EY7,共结晶多奈哌齐)进行Rosetta配体对接,分析催化位点与外周阴离子位点(Peripheral Anionic Site,PAS)双位点相互作用。
研究结果
2.1 化学合成
通过CuAAC将芦宁叠氮与N-丙炔基毒芹碱、金雀花碱丙炔醚、黄嘌呤丙炔衍生物及秋水仙碱丙炔胺偶联,获得三唑桥连杂合体5、7、11–13、15,产率72–90%;以自制10-O-丙炔基芦宁碱3为双组分合成双芦宁碱16(产率71%)。另以3参与A3-偶联,与甲醛及二异丙胺、二丁胺、哌啶、氮杂环庚烷生成炔胺醚衍生物20、21、24、25,产率71–84%。结构经核磁、红外、高分辨质谱及单晶X射线确认。
2.2 酶抑制
Ellman法显示所有修饰物均强于母核芦宁碱。三唑双生物碱IC50介于0.035–47.0 μM;茶碱杂合11(0.47 μM)、咖啡因杂合12(0.035 μM)最优;秋水仙碱杂合15(1.3 μM)与双芦宁碱16(1.4 μM)亦显著;哌啶/氮杂环庚烷炔胺24、25(3.4–4.0 μM)优于前体3。12活性可比多奈哌齐。
讨论部分总结
对接表明活性分子呈延伸构象,跨越AChE峡谷,芦宁碱端嵌入深袋(Trp86、Tyr133、His447、Ser203等),另一端居PAS(Tyr72、Tyr124、Trp286、Tyr341)。黄嘌呤连接位点影响显著:12以C8直接连三唑,得分最优;15的秋水仙碱端靠Asp74氢键锚定;24、25因缺芳香端仅范德华或单氢键,活性较弱。pIC50与Interface Score相关(r=-0.82),模型可排序但不能替代绝对亲和力。
结论翻译
综上,研究人员提出CuAAC与A3-偶联方法,将芦宁碱骨架与多种生物碱及含氮取代基偶联,获得新型AChE抑制剂候选物。其中六个新化合物活性可比加兰他敏,1,3,7-三甲基-8-(1-(((1S,9aR)-八氢-1H-喹嗪-1-基)甲基)-1H-1,2,3-三唑-4-基)-1H-嘌呤-2,6(3H,7H)-二酮(12)具纳摩尔级抑制力,可比多奈哌齐。分子对接显示活性分子与Tyr341、Phe338、Trp86、Phe297等关键残基作用,可较好容纳于催化中心。该系列芦宁碱衍生物具进一步研究价值,所建修饰策略可用于构建更广生物活性分子库。
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深入分析化合物12的构效关系 对比本文与他文AChE抑制剂设计思路 深入分析化合物12的构效关系 对比本文与他文AChE抑制剂设计思路