《Agronomy》:Combining Ability of 54 Sunflower Paternal Lines Crossed with Three CMS Testers: Additive Control of Oil Content and Seed Weight and the Choice of Donor Lines
编辑推荐:
为向日葵(Helianthus annuus L.)杂交育种,研究人员评估了54个父本系与3个细胞质雄性不育(CMS)测验种的杂交组合。162个杂交种在一个地点种植两年,并采用小区水平混合模型分析,该模型分离基因型×年份项。含油量的Baker比率为0.958,
为向日葵(Helianthus annuus L.)杂交育种,研究人员评估了54个父本系与3个细胞质雄性不育(CMS)测验种的杂交组合。162个杂交种在一个地点种植两年,并采用小区水平混合模型分析,该模型分离基因型×年份项。含油量的Baker比率为0.958,千粒重为0.951,株高为0.933,前两个性状的杂交种均值遗传力分别为0.90和0.91。剔除两个食用型品系后,这些性状的Baker比率仍为0.877和0.907,遗传力为0.72和0.83。含油量、千粒重、株高和开花期的父本一般配合力(GCA)在两个季节间一致(一致性0.71–0.85)。对于种子产量,未确立加性控制(Baker比率0.440,95%区间0.00–0.82);小区误差为遗传方差的3.6倍,父本GCA弱重复(r = 0.24)。VK101A提高含油量,VK934A提高千粒重和株高,VA761A降低株高。复合指数鉴定出LI18、LI41、LI6、LI53和LI19为候选供体。父本系可基于这三个性状的GCA进行选择;种子产量及依赖该产量的供体排序需要在更多环境中测试。
研究人员针对向日葵(Helianthus annuus L.)杂交育种中父本系评价问题开展了研究。商业化向日葵杂交种由细胞质雄性不育(CMS)雌性系与携带育性恢复基因的父本系杂交产生。育种计划中维持数十个候选父本系,但仅有少数可被推进,品系的价值体现在其杂交组合中的表现,由一般配合力(GCA)和特殊配合力(SCA)描述。品系×测验种设计(North Carolina Design II的一种形式)可分离这两个来源,适用于以少量测验种评价大量自交系。GCA与SCA的相对大小常以Baker比率概括:比率接近1意味着杂交种可由亲本GCA预测,父本系可依据自身GCA选择;比率低则意味着杂交种价值取决于特定组合,必须通过测试该组合确定。向日葵中的品系×测验种和双列杂交研究报道了种子产量、含油量、千粒重和物候期的配合力,但许多研究依赖小规模组合。近期一项研究认为大多数性状以非加性效应为主。当配合力由跨季节均值估计时,基因型×年份互作保留在SCA项中,可能改变比率,预计对种子产量影响最大。拟合于小区数据的混合模型通过限制性最大似然(REML)估计GCA和SCA方差,将小区误差和基因型×年份项排除在SCA估计之外,并给出杂交种均值的遗传力。研究人员分析了来自全俄油料作物研究所(VNIIMK)育种计划的完整品系×测验种组合,该组合包含54个父本系与3个CMS测验种杂交的162个杂交种,两年三重复评价。采用小区水平单一混合模型分离父本GCA、SCA、两个基因型×年份项和小区误差,据此鉴定杂交种变异呈加性且年度间一致的性状,以便依据GCA选择父本系,描述各测验种的贡献,并选择候选供体系。研究得出:含油量、千粒重和株高以加性控制为主,即使剔除两个食用型品系后亦然;这些性状的父本GCA在两个季节间一致,父本系可依据GCA选择;种子产量GCA在一个地点两年内未确立,依赖产量的五个候选供体系排序应在更多环境测试后方可使用。该研究为向日葵杂交育种中父本系的早期筛选提供了统计学依据,并明确了不同性状可依据GCA选择的条件与产量性状需多环境测试的界限。
研究人员采用的关键技术方法包括:构建54个父本系(LI1–LI54)与3个CMS测验种(VK101A、VA761A、VK934A)的完全品系×测验种交配设计,获得162个杂交种;杂交种于2022和2023年在俄罗斯克拉斯诺达尔VNIIMK试验田种植,每年3重复,小区为单行10 m、行距0.7 m(7 m2),密度60,000株/ha?1,前作为冬小麦;采用小区水平线性混合模型,年份、年份内重复、测验种及年份×测验种为固定效应,父本系、测验种×品系、年份×品系及年份×测验种×品系为随机效应,方差组分以REML估计;以似然比检验年份×品系项;计算Baker比率(含种子产量、含油量、千粒重的剖面似然95%区间)、杂交种均值广义遗传力和单小区重复力;以两年杂交种均值计算GCA效应,并与lme4拟合的BLUP比较;以Lin一致性相关系数和Pearson相关评价GCA年度间一致性;构建复合选择指数(种子产量权重0.35、含油量0.30、出苗至开花期0.15并反号、千粒重0.10、头直径0.10、株高0),并以bootstrap(2000次)评估前列品系稳定性;分析在Python 3.12.10中完成,方差组分以R 4.5.3的lme4 2.0.6再现。
研究结果如下:
3.1 方差组分与Baker比率:父本系组分是含油量和千粒重的最大方差组分,分别占组分和的59%和65%;Baker比率为0.958(95%区间0.917–0.984)和0.951(0.907–0.979),杂交种均值遗传力为0.90和0.91,单小区重复力为0.64和0.71。千粒重的年份×品系项与零不可区分(0.35 ± 1.29,p = 0.39),但标准误约为估计值的四倍,属估计不精确而非证明不存在。株高表现类似(Baker比率0.933 ± 0.029,遗传力0.82),出苗至开花期给出六性状中最高比率0.973(95%区间0.917–1.00),GCA方差2.41天2,SCA方差0.13,年份×品系方差0.11。种子产量不符合此模式:小区误差占组分和的59%,父本系仅占5%,误差方差(0.258)为整个遗传方差(0.071)的3.6倍;SCA组分点估计(0.051 ± 0.017)超过GCA组分(0.020 ± 0.022);年份×品系组分(0.076 ± 0.023)为GCA组分的3.8倍且显著(似然比22.1,p = 1.3 × 10??);Baker比率0.440,95%区间(0.00–0.82)与以加性为主和以非加性为主均相容;杂交种均值遗传力0.43,单小区重复力0.16。头直径居中间:遗传方差以GCA为主(Baker比率0.801 ± 0.167),但小区误差占组分和的67%,单小区重复力低(0.15)。测验种区块内相邻小区误差对株高、千粒重和头直径呈正相关(2022年滞后1相关0.34–0.44,2023年0.18–0.59),含油量弱相关(2022年0.20),种子产量无相关;允许各区块内二次趋势使小区误差降低1–17%,Baker比率变动0.004–0.023(种子产量0.453、含油量0.954、千粒重0.958、株高0.910、头直径0.824),趋势校正值的GCA效应与报告值相关0.93(株高)至1.00。剔除两个食用型品系后,含油量和千粒重的加性方差仍占优,但父本GCA组分变小:Baker比率0.877(0.736–0.969)和0.907(0.816–0.967),GCA份额从59%降至27%、从65%降至45%,杂交种均值遗传力从0.90降至0.72、从0.91降至0.83;株高、头直径和种子产量变化不大(Baker比率0.941、0.777和0.417)。因此两个食用型品系携带含油量父本GCA方差的大部分,但并不造成加性模式。
3.2 父本GCA的年度间一致性:在52个油料用品系中,2022年估计的GCA与2023年估计的GCA对含油量(一致性0.71;r = 0.75,95% CI 0.60–0.85)和千粒重(0.85;r = 0.85,0.75–0.91)一致,对全部54个品系的株高(0.81;r = 0.84,0.75–0.91)和出苗至开花期(0.83;r = 0.83,0.72–0.90)一致;头直径(0.37;r = 0.37,0.11–0.58)和种子产量(0.24;r = 0.24,?0.03至0.48)一致性弱,即一年高产的GCA仅是另一年高产GCA的弱指示。
3.3 测验种效应:三个测验种的杂交种性状谱不同。VK101A给出最高含油量(测验种GCA +1.20%)和最早开花(约早于均值1.1天);VK934A给出最大种子(+10.8 g)和最高植株(+8.3 cm),开花约晚于均值1.3天;VA761A给出最矮杂交种(约低于均值10 cm)。测验种间种子产量差异小,其GCA在距总均值±0.07 t/ha以内。由于每个测验种在重复内占一个区块,这些测验种效应包含区块位置;它们在不同田块的两年和所有重复中符号相同、大小相似。
3.4 选择指数与候选供体系:选择指数将LI18、LI41、LI6、LI53和LI19列于前列,指数值为0.902、0.799、0.797、0.681和0.648。五个品系均结合高种子产量GCA与正含油量GCA,在其他性状上不同:LI6早熟,而LI18、LI53和LI19晚熟,LI19和LI18提高株高。混合模型父本系效应BLUP与基于均值的GCA在五个性状上相关0.995–1.000、头直径0.96,基于BLUP重算的指数将同样五个品系列于前列,LI41与LI18互换位置。BLUP按性状可靠性成比例向零收缩品系差异:种子产量收缩因子0.21,含油量、千粒重和出苗至开花期为0.89–0.96;种子产量的品系效应条件标准误(0.125 t/ha)为BLUP全距(0.32 t/ha)的五分之二,故品系在该性状上未被区分。LI20、LI26和LI37仅有两个杂交种,其标准误比其他品系大1–5%。基于趋势校正小区值重算的指数保持同样五个品系居前,LI53与LI19互换位置(与报告指数的秩相关0.99)。数据未解析组内顺序:bootstrap中LI18进入前五的重复占85%,LI41为75%,LI6为63%,LI53为58%,LI19为44%;其他品系中LI33最常进入前五(26%)。指数主要由种子产量驱动:从指数中剔除产量后,五个品系中仅两个留在前五;剔除任何其他性状则有四或五个留在前五。
讨论部分总结:4.1 含油量、千粒重和株高的父本GCA选择——本组合中这三个性状的杂交种变异 largely 为加性,Baker比率超过0.93,杂交种均值遗传力0.82–0.91;剔除两个食用型品系后比率仍高于0.87,遗传力0.72–0.83。然而含油量父本GCA方差的大部分反映油用与食用型品系间的对比:油用品系中GCA份额为27%,含食用型品系时为59%,杂交种均值遗传力分别为0.72和0.90。52个油料用品系中含油量和千粒重的父本GCA一年与另一年一致,全部54个品系的株高GCA亦然。父本系可依据这些性状的自身GCA选择,且含油量和千粒重的GCA从一个测交季节即为有用指南,这与36个雌性系和36个雄性系在九个环境测试的向日葵析因试验一致。近期小规模向日葵品系×测验种研究认为大多数性状以非加性效应为主,而在本研究一个计划的54个父本系组合中,无论是否含食用型品系,含油量和千粒重均以父本GCA为主。4.2 种子产量GCA未被一个地点两年确立——种子产量数据的小区误差为遗传方差的3.6倍,年份×品系互作超过GCA方差本身,2022年品系GCA仅弱预测2023年GCA(r = 0.24);在此条件下GCA组分估计不精确,Baker比率95%区间(0.00–0.82)覆盖大部分可能范围。因此研究人员不结论种子产量受非加性控制;SCA估计约高于零三个标准误,属近似比较而非正式检验,且超过GCA估计。这与向日葵籽粒产量报道的低GCA/SCA方差比一致,后者被暂归因于缺乏遗传分化的杂种优势群;在中欧材料中,组内与组间杂交的SCA方差相似。数据仍不能说明产量以加性还是非加性为主,但确实表明两年单地点测交不能可靠排序父本系的产量;基因型×环境互作是向日葵产量试验的已知特征,产量的GCA和SCA可随环境改变。对产量而言,有希望的组合应在更多年份和地点评价后再依据产量GCA排序父本系。4.3 测验种选择——三个测验种贡献不同性状,故测验种可依据杂交种品质或形态目标选择;其平均种子产量在距总均值±0.07 t/ha以内,但产量的SCA超过GCA,故杂交种产量取决于特定组合而非仅测验种。仅三个测验种时,这些陈述描述特定CMS系,不能推广为测验种方差;且因每个测验种在重复内形成一个区块,测验种效应不能与区块位置分离。4.4 候选供体系——五个候选品系结合高产GCA与正含油量GCA;然而指数由种子产量主导,而该性状GCA年度间最不可重复,其权重0.35反映产量的经济重要性而非其GCA精度,后果是剔除产量后五个品系中仅两个留在前五,且组内顺序未解析。研究人员推荐五个品系作为多环境测试的候选集合;对含油量和千粒重,因GCA年度间一致,品系也可依据表中GCA值排序。4.5 局限性——所有杂交种数据来自单一地点和两个季节,故GCA年度间一致性显示该地点季节间的一致性而非跨环境稳定性,种子产量GCA及依赖它的供体系排序在其他地点可能改变;出苗至开花期仅有组合-年份均值,故其遗传力和小区重复力无法估计;株高和头直径的田间记录2022年覆盖两个重复;小区系统排列于测验种区块内,2022年区块内品系按编号顺序播种,未记录小区坐标,故无法拟合空间模型;此排列有两个后果:测验种效应与区块位置混杂,品系效应则不然,因每个品系均在同一区块内与其他品系比较,但沿区块的梯度会增加相邻品系间差异;小区误差确显示此类梯度,对株高最强,允许该梯度使Baker比率变动至多0.023,GCA效应变动很小;在不同田块获得的GCA两季一致性不可能是位置假象;两个食用型品系属该组合,其杂交种在含油量和千粒重上独特,品系携带含油量父本GCA方差的大部分,在会扭曲相关的分析中被剔除;GCA效应和选择指数使用两年杂交种均值,混合模型BLUP以相同方式排序品系,它们与小区记录一致,除四个含油量和两个头直径值外,这些值仍包括被离群筛选从小区记录中剔除的小区,差异至多3.9个百分点和4.5 cm。研究结论部分翻译:在54个VNIIMK父本系的162个杂交种中,含油量、千粒重和株高以加性控制为主,即使剔除两个食用型品系亦然;该地点两个季节间含油量、千粒重和株高的父本GCA一致,父本系可依据这些性状的GCA选择;种子产量GCA在一个地点两年内未确立;依赖产量的五个候选供体系排序应在使用前于更多环境测试。