高亲和力 O-GlcNAc 特异性抗体 EPR19847 的开发及其在干细胞中的基因组分布分析

《Nature Communications》：A nanomolar-affinity antibody enabling sensitive labeling and high-resolution genomic mapping of O-GlcNAc

　　

摘要

高亲和力的O-连接β-N-乙酰葡糖胺（O-GlcNAc）特异性抗体对于敏感检测和功能性研究O-GlcNAcylation过程至关重要。在本研究中，我们利用一种退化型的O-GlcNAc化肽作为免疫原，开发出一种纳摩尔级亲和力的O-GlcNAc抗体EPR19847。该抗体可用于O-GlcNAc的检测、成像、分离以及染色质免疫沉淀分析。利用该抗体，可以在小鼠胚胎干细胞（mESCs）中富集并鉴定出被O-GlcNAc修饰的蛋白质。通过染色质免疫沉淀结合下一代基因组测序技术发现，O-GlcNAc主要富集在高表达基因的启动子区域，并且其基因组分布与mESCs中的转录激活标记（如H3K4me3、H3K9ac和RNA聚合酶II）呈现正相关。进一步分析表明，O-GlcNAc在超增强子区域内具有高度富集现象。我们预计EPR19847将成为一种高效工具，用于高度敏感地检测O-GlcNAc并对其进行系统的功能分析。