MAP-IT：人类原生组织切片中蛋白质 - 蛋白质相互作用的原位定位新方法

《Nature Communications》：Spatial protein interactomics in solid primary human tissue

摘要

在病变组织中，蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）是一类具有潜在药物靶点价值的分子。然而，PPIs 通常是在活细胞、裂解液以及基因工程改造的模型生物中发现的，这限制了它们在人类疾病研究中的应用价值。本文介绍了一种名为 MAP-IT 的优化光催化卡宾基邻近标记方法，该方法可以直接在人类原生组织切片中对 PPIs 进行定位分析，从而无需依赖模型生物来进行初步探索。我们利用 MAP-IT 对细胞表面和核内的目标蛋白进行原位检测，识别并在结肠癌中验证 EGFR 的新相互作用蛋白；同时，将光驱动的 MAP-IT 标记技术与基于神经网络图像分割的空间模式可见光照射技术相结合，以实现特定位置蛋白质相互作用组的精准绘制。