大豆 GmDUF966 基因家族的系统进化分析与长期干旱条件下的组织特异性表达模式
《Genes》:Genome-Wide Characterization of the Soybean DUF966 Gene Family Reveals Tissue- and Cultivar-Dependent Transcript Abundance After Drought Adaptation
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时间:2026年11月05日
来源:Genes 3.1
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摘要
背景/目标:含有未知功能域966(DUF966)的蛋白质已被发现与植物发育和环境响应有关,但大豆DUF966基因家族的多样性及其在长期干旱条件下的组织特异性转录本丰度尚未得到充分研究。本研究旨在表征Gm
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摘要
背景/目标:含有未知功能域966(DUF966)的蛋白质已被发现与植物发育和环境响应有关,但大豆DUF966基因家族的多样性及其在长期干旱条件下的组织特异性转录本丰度尚未得到充分研究。本研究旨在表征GmDUF966基因家族,并探讨其成员在长期干旱处理后的转录本丰度变化。 方法:通过比较基因组学、系统发育学、保守基序分析、基因结构分析以及启动子顺式元件分析来研究GmDUF966家族。利用公共转录组数据集评估组织特异性表达模式。在干旱处理15天后,测定了五个大豆品种的根部和叶片中的转录本丰度,并同时监测了脂质过氧化、脯氨酸积累、抗氧化酶活性和水溶性蛋白含量的生理变化。 结果:在八个大豆染色体上发现了12个GmDUF966基因,并将其分为三个系统发育组。这些基因编码的蛋白质长度介于267至538个氨基酸之间,具有疏水性特征。保守的基序和基因结构与系统发育关系一致,而启动子分析发现了可能的激素和应激响应顺式元件。在干旱处理下,所有五个品种中GmDUF966-7的根部表达均增加。GmDUF966-9在V4和V5期根部的表达显著上升,对数变化分别为8.46和7.69倍。叶片表达则主要降低,而不同品种和组织的生理反应存在差异。 结论:大豆GmDUF966基因具有保守的结构特征和组织依赖性的干旱相关表达模式。GmDUF966-7和GmDUF966-9在长期干旱后表现出最明显的根部转录本差异,值得进一步的功能研究。需要进一步的实验验证以确定其在耐旱性中的作用。
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