一种抗入侵的内源性tRNA衍生的小RNA（3′-tRFAlaAGC）通过抑制MCCC1介导的EMT（上皮间质转化）来缓解子宫内膜异位症

《Cellular Signalling》：An anti-invasion endogenous tRNA-derived small RNA (3′-tRFAlaAGC) alleviates endometriosis by suppressing MCCC1 mediated EMT

　　**摘要**
子宫内膜异位症是一种侵袭性妇科疾病，其特征是隐匿性的异位子宫内膜生长。在多种疾病中都能发现新生的内源性tRNA衍生物片段，但其病理机制在子宫内膜异位症中的具体途径仍不明确。从子宫内膜病变和血清中检测到下调的3′-tRFAlaAGC能够抑制子宫内膜异位症的侵袭性。我们发现，由于3′-tRFAlaAGC与MCCC1蛋白相互作用，依赖于MCCC1中的383-494aa位点（该位点是3′-tRFAlaAGC直接结合的独特位点），导致p65通过MCCC1蛋白的核转运受到抑制。因此，NF-κB通路的激活受到阻碍，进而影响了与子宫内膜异位症进展相关的上皮-间质转化。此外，3′-tRFAlaAGC还能减轻子宫内膜异位症小鼠的病变负担，并且通过机器学习显示出良好的预测效率。了解3′-tRFAlaAGC的作用机制对于揭示子宫内膜异位症的发病机制具有重要意义，为诊断和阻止该疾病的发展提供了新途径。

**引言**
子宫内膜异位症是一种慢性、依赖雌激素的妇科疾病，其特征是类似子宫内膜细胞的组织在身体其他部位生长，表现为严重的痛经、慢性盆腔疼痛、腹部胀气和不孕症[1]、[2]、[3]。其类似恶性肿瘤的侵袭性使得病变可以扩散到盆腔以外，偶尔可累及鼻腔和肺部区域，导致多种临床表现[4]、[5]、[6]、[7]。然而，由于缺乏高度特异性的非侵袭性检测方法以及传统保守激素治疗的不良副作用[2]、[8]、[9]，临床医生很难早期诊断和干预。这些局限性凸显了迫切需要一种新的、具有高效预测性和治疗作用的方法。

**传递RNA衍生的小RNA（tRFs）**
tRFs是在炎症等应激条件下由tRNA切割产生的非随机降解产物[10]。tRFs经过广泛的末端修饰和甲基化，具有较高的稳定性，能够发挥表观遗传调控作用，并影响多种疾病进程[11]、[12]、[13]、[14]、[15]。例如，tiRNAMet通过促进RANBP3L mRNA的稳定化和抑制mTORC1/RPS6信号通路来抑制三阴性乳腺癌的进展[12]；3′-tRFAspGTC则通过诱导RNA自噬来修复肾脏损伤[13]。大规模队列的研究证据表明tiRNAPheGAA可以作为乳腺癌诊断和预后的生物标志物[16]。研究表明，炎症环境可促进tRFs的生成[17]、[18]。因此，tRFs与子宫内膜异位症之间的相互作用可能为开发新的预测和治疗策略提供帮助[19]。

**本研究描述了一种源自丙氨酸和丝氨酸转移RNA（3′-tRFAlaAGC）3′端的tRNA衍生物片段**。研究发现，子宫内膜异位症中3′-tRFAlaAGC的缺失会加速病变进展。进一步的研究表明，3′-tRFAlaAGC通过与MCCC1直接结合，抑制NF-κB通路中p65的核转运，从而阻碍子宫内膜异位症病变的上皮-间质转化（EMT）。最终，我们的结果表明3′-tRFAlaAGC通过调控MCCC1和下游NF-κB信号通路来促进子宫内膜异位症的转移性进展。

**关键资源表**
| 物品 | 来源 | 标识符 |
| ---- | ---- | ---- |
| 抗体 | Vimentin | 抗体注册库 | RRID: AB_10562134 |
| 抗体 | Cytokeratin | 抗体注册库 | RRID: AB_869901 |
| 抗体 | P65 | 抗体注册库 | RRID: AB_776751 |
| CoraLite 488结合Affinipure山羊抗兔IgG | 抗体注册库 | RRID: AB_2797132 |
| N-Cadherin | 抗体注册库 | RRID: AB_444317 |
| β-Catenin | 抗体注册库 | RRID: AB_725966 |
| MCCC1 | 抗体注册库 | RRID: AB_3086226 |
| 山羊抗兔IgG H&L（HRP） | 抗体注册库 | RRID: AB_2819160 |

**化学物质、肽和重组蛋白**
为了研究参与子宫内膜异位症的tRFs，我们对从5对异位病变（EcE）和正常子宫内膜（EuE）中分离出的tRFs进行了高通量测序（图1A，S1A）。tRFs的表达具有非随机性（图S1B）。测序共鉴定出294种tRFs：5′-tRFs在正常子宫内膜中富集，而3′-tRFs在异位病变中减少（图S1C）。其中，有8种tRFs在异位病变中上调，3种下调（图1B，S1D）。额外的20个样本的qRT-PCR结果进一步证实了这一现象。

**讨论**
目前的研究结果表明，3′-tRFAlaAGC与子宫内膜异位症之间存在密切关联，特别是下调的3′-tRFAlaAGC与子宫内膜异位症的进展相关。深入研究显示，3′-tRFAlaAGC通过与MCCC1相互作用，抑制NF-κB通路中p65的核转运，从而减少病变处的上皮-间质转化（EMT）。Boost模型在识别漏诊的子宫内膜异位症病例方面表现出高效。

**联系方式**
如需进一步的信息和资源，请联系主要联系人Shi Xiaoyan（[e-mail]），她将为您提供帮助。

**材料与代码的获取**
本研究生成的所有独特/稳定的试剂均可向主要联系人索取。
高通量测序数据已存储在GEO数据库中（GSE246202），截至发表日期可供公开获取。
本文报告的其他数据将在需要时由主要联系人提供。
所有原始代码已保存在GitHub上，同样可在需要时获取。

**关于生成式AI和AI辅助技术的声明**
在本文的准备过程中，所有作者均未使用AI和AI辅助技术。

**作者贡献说明**
Hengmei Shi：撰写、审稿与编辑、初稿撰写、软件开发、数据分析；
Senhui Zhang：撰写、审稿与编辑、软件开发、数据管理；
Huyang Hou：数据可视化、结果验证、软件开发；
Tong Li：数据可视化、结果验证、软件开发；
Danni He：结果验证、方法学设计；
Deshuo Jiang：数据可视化、结果验证；
Xin Cheng：结果验证、研究监督；
Le Ma：结果验证；
Xuan Lin：方法学设计；
Yangkaiyuan Liu：结果验证；
Zheng Ding：软件开发；
Hongjie Ruan：研究监督、伦理声明。

**参与者知情同意**
所有参与者或其法定代理人均已书面同意参与研究并发表论文。参与者的隐私权得到充分保护。
本研究使用了人体生物样本，采样得到了捐赠者或其家属或法定代理人的同意。

**利益冲突声明**
作者声明没有已知的可能影响本研究结果的财务利益或个人关系。

**致谢**
所有作者感谢实验室工作人员在样本制备和分析方面的辛勤工作。本研究得到了国家自然科学基金（项目编号：82173327、82272916）的财政支持。

**作者名单**
Hengmei Shi | Senhui Zhang | Huyang Hou | Tong Li | Danni He | Deshuo Jiang | Xin Cheng | Le Ma | Xuan Lin | Yangkaiyuan Liu | Zheng Ding | Hongjie Ruan | Ziyi Fu | Xiaoyan Shi
南京医科大学妇产科，中国南京