《aBIOTECH》：Fruit microbiome: from descriptive profiling to functional understanding and applications
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摘要果实微生物组影响着果实的健康状况、采后品质、食品安全以及人体对 dietary microorganisms（饮食微生物）的暴露情况。从扩增子测序和鸟枪法宏基因组学，到基因组解析分析、菌群组学、代谢组学以及功能验证等技术，都在不断加深我们对微生物群落组成及其对果实特性影响的理
摘要
果实微生物组影响着果实的健康状况、采后品质、食品安全以及人体对 dietary microorganisms（饮食微生物）的暴露情况。从扩增子测序和鸟枪法宏基因组学，到基因组解析分析、菌群组学、代谢组学以及功能验证等技术，都在不断加深我们对微生物群落组成及其对果实特性影响的理解。果实微生物组为生物防治、采后品质保护以及食品安全监测等领域提供了广阔的应用前景，同时也充当了植物相关微生物组与人体微生物暴露之间的重要桥梁。尽管取得了这些进展，该领域仍面临诸多挑战，包括微生物生物量较低、宿主DNA污染、元数据标准不统一以及缺乏针对特定果实的参考资源等。本文综述了当前果实微生物组研究的发展现状，并探讨了建立一套综合方法框架的必要性，以将微生物群落分析与机制研究及实际应用有效结合。要实现这些目标，需要制定标准化的实验设计、对低生物量样本进行质量控制、实现多组学数据的整合、进行功能验证以及开展预测建模，从而为可持续园艺和食品系统的健康发展提供基于微生物组的研究支持。
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