胃贲门前体病变黏膜相关微生物组重塑与宿主表观遗传改变的关联

《Gut Pathogens》：Stage-associated mucosal microbiome remodeling and host epigenetic alterations in gastric cardia precancerous lesions: a cross-sectional multi-omics study

【字体：大中小】 时间：2026年11月06日 来源：Gut Pathogens 5.0

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　　摘要背景胃贲门腺癌（GCA）具有明显的地理聚集特征，但其前体病变中的微生物变化仍不明确。我们研究了正常胃贲门黏膜、肠化生（IM）和上皮内瘤变（IEN）中的黏膜相关微生物组，并探讨了其与宿主表观遗传改变之间的关联。结果在这项横断

摘要

背景

胃贲门腺癌（GCA）具有明显的地理聚集特征，但其前体病变中的微生物变化仍不明确。我们研究了正常胃贲门黏膜、肠化生（IM）和上皮内瘤变（IEN）中的黏膜相关微生物组，并探讨了其与宿主表观遗传改变之间的关联。

结果

在这项横断面研究中，对71个胃贲门黏膜样本进行了16S rRNA基因测序，其中包括17个正常样本、44个肠化生样本和10个上皮内瘤变样本。微生物组数据与之前发表的匹配样本的DNA甲基化和RNA-seq谱进行了整合。幽门螺杆菌的定植情况通过免疫组化（IHC）在独立扩展的队列中进行了评估，该队列中没有重叠的参与者。未调整分析中，不同组织类型的alpha多样性没有显著差异，而微生物群落组成存在差异（Bray–Curtis PERMANOVA R2 = 0.115，P = 0.001），即使在调整了年龄和性别后，这种差异仍然存在。幽门螺杆菌在肠化生/上皮内瘤变组合组中较为丰富。在独立的IHC队列中，幽门螺杆菌的阳性率在上皮内瘤变组最高（33例中有19例）。奈瑟菌在病变样本中的相对丰度较低，而由Greengenes2识别的假想物种Gemella morbillorum和Leptotrichia trevisanii在上皮内瘤变样本中更为常见。探索性的菌群失调评分与基因沉默评分相关（Spearman rho = 0.61，P = 5.51 × 10??），即使在调整了年龄、性别和组织类型后，这种关联仍然具有名义上的显著性。由于微生物和宿主特征是在研究数据集内选定的，并且评分是在数据集内部评估的，因此这些关联可能受到特征选择偏差的影响。