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赤霉素处理对 Sistan Yaghooti 葡萄果串紧凑度形成的转录组分析

《BMC Genomic Data》:Transcriptome profiling of cluster tissues during developmental stages in Vitis vinifera cv. Sistan Yaghooti cultivar under gibberellin treatment

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年11月06日 来源:BMC Genomic Data 2.5

编辑推荐:

  摘要果串紧凑度是影响鲜食葡萄品种果实品质和抗病性的重要农艺性状。为了研究果串结构形成的转录机制以及赤霉素(GA)处理的效果,我们对经过GA处理的植株和对照植株在三个发育阶段的Vitis vinifera cv. Sistan Yaghooti果串组织进行了RNA-seq分析。使用

摘要

果串紧凑度是影响鲜食葡萄品种果实品质和抗病性的重要农艺性状。为了研究果串结构形成的转录机制以及赤霉素(GA)处理的效果,我们对经过GA处理的植株和对照植株在三个发育阶段的Vitis vinifera cv. Sistan Yaghooti果串组织进行了RNA-seq分析。使用TruSeq Stranded Total RNA(植物)试剂盒制备文库,并在Illumina HiSeq 2500平台上进行测序,生成了380,460,946条双端测序数据(长度为101 bp)。分析结果共检测到19,194个可变剪接(AS)事件、2,021个长链非编码RNA(lncRNAs)和3,715个高置信度的环状RNA(circRNAs)。测序数据的质量、与PN40024参考基因组的映射效率以及组装指标均表明该数据集具有较高的技术质量。这些测序数据已存入NCBI的SRA数据库,访问号为PRJNA1098654。这些公开共享的数据为揭示Sistan Yaghooti葡萄果串形成和紧凑性的分子基础提供了研究资源,将有助于标记的发现和育种策略的开发,从而改善果串结构和果实品质。

果串紧凑度是影响鲜食葡萄品种果实品质和抗病性的重要农艺性状。为了研究果串结构形成的转录机制以及赤霉素(GA)处理的效果,我们对经过GA处理的植株和对照植株在三个发育阶段的Vitis vinifera cv. Sistan Yaghooti果串组织进行了RNA-seq分析。使用TruSeq Stranded Total RNA(植物)试剂盒制备文库,并在Illumina HiSeq 2500平台上进行测序,生成了380,460,946条双端测序数据(长度为101 bp)。分析结果共检测到19,194个可变剪接(AS)事件、2,021个长链非编码RNA(lncRNAs)和3,715个高置信度的环状RNA(circRNAs)。测序数据的质量、与PN40024参考基因组的映射效率以及组装指标均表明该数据集具有较高的技术质量。这些测序数据已存入NCBI的SRA数据库,访问号为PRJNA1098654。这些公开共享的数据为揭示Sistan Yaghooti葡萄果串形成和紧凑性的分子基础提供了研究资源,将有助于标记的发现和育种策略的开发,从而改善果串结构和果实品质。

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