《SCIENCE ADVANCES》:On-virion structural dynamics reveal temperature- and receptor-coordinated activation of an alphacoronavirus spike
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人类甲型冠状病毒主要感染上呼吸道,但温度与受体结合如何协同调控刺突(S)蛋白激活仍不清楚。研究人员利用冷冻电子断层扫描(cryo-ET)与亚断层平均(STA),在生理相关温度及宿主受体人氨肽酶N(hAPN)存在条件下,直接可视化了人冠状病毒229E(HCoV-
人类甲型冠状病毒主要感染上呼吸道,但温度与受体结合如何协同调控刺突(S)蛋白激活仍不清楚。研究人员利用冷冻电子断层扫描(cryo-ET)与亚断层平均(STA),在生理相关温度及宿主受体人氨肽酶N(hAPN)存在条件下,直接可视化了人冠状病毒229E(HCoV-229E)病毒粒子表面S蛋白的结构动态。研究人员鉴定出两种可逆互变的融合前S2构象——致密(compact)与松弛(loose),其转换由温度驱动,揭示出病毒粒子原位S2亚基的“呼吸”运动。受体结合域(RBD)向上构象在脱受体(apo)病毒粒子中稀少,但在33°C被促进,并在受体结合后被稳定。hAPN可双价结合相邻S,形成Gemini S-hAPN复合体。受体孵育进一步促进从融合前向融合后S转变,该效应在33°C增强。结果表明HCoV-229E存在最适温度以维持病毒适应度,并确立温度与受体结合作为甲型冠状病毒S激活的协同调控因子,为理解其感染性提供结构框架。
论文解读:病毒粒子原位刺突蛋白的温度—受体协同激活机制
研究背景与立项依据
人类冠状病毒感染长期被视为普通感冒病原,HCoV-229E与HCoV-NL63同属甲型冠状病毒(alphacoronavirus),主要定植上呼吸道。已有研究对β冠状病毒(如SARS-CoV-2)刺突(S)蛋白构象动态理解较深,但甲型冠状病毒S利用氨基肽酶N(APN)家族受体,其S1亚基采用独特的分子内结构域堆积模式,N端结构域(NTD)限制受体结合域(RBD)运动,导致RBD向上(up)状态难以捕获。既往结构多来自重组可溶性S胞外区,缺乏膜环境、天然糖基化与病毒粒子原位互作背景;温度是否直接调控S2构象、受体如何稳定激活态、融合前到融合后转变如何发生,均为未解问题。该文发表于《SCIENCE ADVANCES》,针对HCoV-229E开展原位结构生物学研究,具有明确的机制探索与疫苗/抗病毒设计指向。
关键技术方法概述
研究人员以Huh-7细胞扩增的HCoV-229E(ATCC VR740)活病毒粒子为样本,设置33°C与4°C温控队列及可固定对照,并以可溶性hAPN胞外区孵育建立受体结合队列。核心方法为冷冻电子断层扫描(cryo-ET)结合亚断层平均(STA),对完整病毒粒子表面S进行原位分类重构;辅以单颗粒冷冻电镜解析apo hAPN闭合态,以及焦点形成 assay 评估感染适应性。方法学关键在于保留膜语境与原位糖基化,而非仅用2P稳定突变体可溶性胞外区。
研究结果
Apo与hAPN孵育HCoV-229E样本总体特征
通过SDS-PAGE与免疫荧光确认33°C扩增病毒活性优于37°C,且8小时温育内S无降解;据此建立33°C培养、4°C冷却、PFA固定与活病毒受体孵育多组对照,用于系统比较构象景观。
HCoV-229E病毒粒子上融合前S的分子景观
STA显示完整病毒粒子表面平均约11个融合前S,存在RBD闭合、S2致密(compact)与S2松弛(loose)两类基础构象;S2-loose相对compact整体缩短约17 ?、增宽约11 ?,中央螺旋与融合肽外移。
HCoV-229E病毒粒子上融合前S的构象动态
在apo病毒粒子上,4°C以S2-compact为主,33°C出现compact/loose共存;4°C可检出稀少的单RBD-up(占S2-compact约2.2%),33°C apo反而难检RBD-up,但加入hAPN后两类S2中均出现RBD-up并被稳定。
温度驱动S2亚基可逆构象转变
时序温控证明:33°C→4°C快速转向compact;4°C→33°C缓慢回弹至loose,延长时间比例升至约28%。S2“呼吸”可逆,且低温转变快于复温转变,说明热运动降低S2张开能垒。
hAPN受体诱导病毒粒子上S的进一步构象变化
hAPN在33°C长期孵育下结合丰度显著上升,形成Solo(单S结合)与Gemini(hAPN双价桥接两邻近S)两类复合体;受体结合推动RBD-up稳定,并协同温度使融合后S比例在33°C增加约4倍、4°C增加约90%。
讨论与结论翻译
讨论部分指出,该研究首次在病毒粒子原位证明HCoV-229E S同时存在compact与loose融合前态并可温控互变;RBD-up并非仅依赖2P突变或可溶性体系,而可在apo低温采样、受体结合后于两类S2中呈现。Gemini S-hAPN复合体直接证实二聚受体可交联两个S三聚体,类似于ACE2二聚体对SARS-CoV-2的簇集效应,可能通过多价附着与协同膜融合提升进入效率。研究局限在于使用可溶性hAPN而非细胞表面受体,因此长时孵育需求不等同于体内时标。
结论部分译述:
研究人员提出温度—受体依赖的HCoV-229E S激活模型:低温下S以RBD闭合、S2-compact为主;33°C使平衡向S2-loose偏移并允许RBD-up采样;hAPN结合锁定RBD-up,形成Solo/Gemini复合体,促进S1解离与S2重排,最终驱动膜融合与融合后态生成。该工作确立温度与受体结合为甲型冠状病毒S激活的协同调控因素,并为靶向S2松弛态表位与泛甲型冠状病毒疫苗设计提供结构依据。
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