《Plant and Cell Physiology》:TurboID proximity labeling combined with structure prediction identifies C3H61/AtTZF5 as a tail-binding protein of Arabidopsis class VIII myosin ATM1

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年11月06日 来源:Plant and Cell Physiology 4.7

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   摘要 高等植物拥有两类肌球蛋白分子马达:XI类和VIII类,这两类肌球蛋白都是植物特有的。XI类肌球蛋白的多种细胞功能,包括细胞器运输和核定位,主要是通过系统地识别与它们的球形尾部结构(GTDs)结合的适配蛋白

  

摘要

高等植物拥有两类肌球蛋白分子马达:XI类和VIII类,这两类肌球蛋白都是植物特有的。XI类肌球蛋白的多种细胞功能,包括细胞器运输和核定位,主要是通过系统地识别与它们的球形尾部结构(GTDs)结合的适配蛋白来阐明的。相比之下,尚未进行过针对VIII类肌球蛋白尾部结合蛋白的广泛蛋白质组学研究;目前已知的少数结合蛋白都是通过研究其结合伙伴而非肌球蛋白本身发现的,因此VIII类肌球蛋白相关蛋白的完整谱系仍然知之甚少。在这里,我们采用了基于TurboID的邻近标记技术,系统地识别了与拟南芥(Arabidopsis thaliana)中VIII类肌球蛋白ATM1的GTDs结合的蛋白质。这种技术可以在体内将邻近蛋白质共价生物素化,从而即使在细胞裂解过程中发生蛋白降解后也能实现这些蛋白质的识别。我们鉴定出了233种非冗余的ATM1邻近蛋白。这些候选蛋白通过基于AlphaFold3的蛋白质复合体结构预测进行优先排序,并通过实验进行了验证。通过整合AlphaFold3预测结果、共免疫沉淀实验、应激状态下活细胞中的亚细胞共定位以及基于结构的界面突变分析,我们确定了C3H61/AtTZF5作为ATM1的尾部结合蛋白。C3H61/AtTZF5是一种串联的CCCH锌指蛋白,其家族成员此前已被证实与mRNA的周转有关;它在热应激条件下与eIF4A2阳性颗粒中的ATM1尾部发生共定位,而在AlphaFold3预测的界面处进行定点替代后,这种相互作用完全消失了。这些发现强烈支持ATM1与C3H61/AtTZF5之间存在直接关联,这表明VIII类肌球蛋白可能与应激反应过程中的转录后基因调控有关。

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