嗜盐耐碱新种 Halalkalibacter haasae sp. nov. 与 Halalkalibacter salibacillus sp. nov. 的分离鉴定、生物学特征及基因组分析

《BMC Microbiology》：Genomic insights into the genus Halalkalibacter and proposal of two novel Halalkalibacter species, Halalkalibacter haasae sp. nov., and Halalkalibacter salibacillus sp. nov

　　

摘要

背景

本研究旨在探讨Halalkalibacter属的基因组特征，并利用多相分析方法评估从盐碱土壤中分离出的嗜盐耐碱菌株HAAS-P013^T和HAAS-P014^T的分类位置。

结果

HAAS-P013^T和HAAS-P014^T菌株均为革兰氏阳性、需氧、运动能力较强且呈杆状。系统发育分析和16S rRNA基因序列分析均将其归类为Halalkalibacter属。HAAS-P013^T菌株在12–45°C（最适生长温度32°C）和pH 6.0–11.0（最适pH 10.0）的条件下生长，并能耐受高达15%（w/v）的NaCl浓度；而HAAS-P014^T菌株则在12–45°C（最适生长温度37°C）和pH 7.0–11.0（最适pH 10.0）的条件下生长，且能耐受高达20%（w/v）的NaCl浓度。这两种菌株的极性脂质包括meso-2,6-二氨基吡梅酸、MK-6和MK-7（作为甲萘醌），以及二膦脂酰甘油、磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺等脂质成分；其主要脂肪酸为anteiso-C_15:0和C_16:0。HAAS-P013^T菌株还含有两种未鉴定的磷脂，而HAAS-P014^T菌株含有一种未鉴定的磷脂。对HAAS-P013^T和HAAS-P014^T菌株的基因组分析显示，其中存在多个可能与渗透压和碱胁迫反应相关的基因。HAAS-P013^T、HAAS-P014^T与其他Halalkalibacter物种之间的平均核苷酸同源性及DNA-DNA杂交值低于物种鉴定的阈值（95-96%/70%）。

结论

根据上述研究结果，HAAS-P013^T和HAAS-P014^T代表Halalkalibacter属的两个新物种，分别命名为Halalkalibacter haasae sp. nov.和Halalkalibacter salibacillus sp. nov.。其模式菌株分别为HAAS-P013^T（= KCTC 43869^T = GDMCC 1.6158^T）和HAAS-P014^T（= KCTC 43870^T = GDMCC 1.6094^T）。

背景

本研究旨在探讨Halalkalibacter属的基因组特征，并利用多相分析方法评估从盐碱土壤中分离出的嗜盐耐碱菌株HAAS-P013^T和HAAS-P014^T的分类位置。

结果

HAAS-P013^T和HAAS-P014^T菌株均为革兰氏阳性、需氧、运动能力较强且呈杆状。系统发育分析和16S rRNA基因序列分析均将其归类为Halalkalibacter属。HAAS-P013^T菌株在12–45°C（最适生长温度32°C）和pH 6.0–11.0（最适pH 10.0）的条件下生长，并能耐受高达15%（w/v）的NaCl浓度；而HAAS-P014^T菌株则在12–45°C（最适生长温度37°C）和pH 7.0–11.0（最适pH 10.0）的条件下生长，且能耐受高达20%（w/v）的NaCl浓度。这两种菌株的极性脂质包括meso-2,6-二氨基吡梅酸、MK-6和MK-7（作为甲萘醌），以及二膦脂酰甘油、磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺；其主要脂肪酸为anteiso-C_15:0和C_16:0。HAAS-P013^T菌株还含有两种未鉴定的磷脂，而HAAS-P014^T菌株含有一种未鉴定的磷脂。对HAAS-P013^T和HAAS-P014^T菌株的基因组分析显示，其中存在多个可能与渗透压和碱胁迫反应相关的基因。HAAS-P013^T、HAAS-P014^T与其他Halalkalibacter物种之间的平均核苷酸同源性及DNA-DNA杂交值低于物种鉴定的阈值（95-96%/70%）。

结论

根据上述研究结果，HAAS-P013^T和HAAS-P014^T代表Halalkalibacter属的两个新物种，分别命名为Halalkalibacter haasae sp. nov.和Halalkalibacter salibacillus sp. nov。其模式菌株分别为HAAS-P013^T（= KCTC 43869^T = GDMCC 1.6158^T）和HAAS-P014^T（= KCTC 43870^T = GDMCC 1.6094^T）。