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TET2 和 TP63 对 D-氨基酸氧化酶基因表达的转录调控机制研究

《Amino Acids》:Gene regulatory proteins TET2 and TP63 affect the expression of the human D-amino acid oxidase gene

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年11月07日 来源:Amino Acids 3.2

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  摘要D-氨基酸氧化酶(DAO)是D-氨基酸代谢中的关键酶,影响着多种生理和病理过程,包括肾脏疾病。然而,调控DAO基因表达的机制在很大程度上仍然未知。在这项研究中,我们通过识别与DAO基因启动子和内含子1区域结合的因素,并评估这些因素对DAO表达的影响,来研究DAO基因的转录调控

摘要

D-氨基酸氧化酶(DAO)是D-氨基酸代谢中的关键酶,影响着多种生理和病理过程,包括肾脏疾病。然而,调控DAO基因表达的机制在很大程度上仍然未知。在这项研究中,我们通过识别与DAO基因启动子和内含子1区域结合的因素,并评估这些因素对DAO表达的影响,来研究DAO基因的转录调控机制。我们还探讨了DNA甲基化在此过程中的作用。利用ChIP-Atlas和整合基因组学分析,我们发现了20个候选的基因调控蛋白。对HK-2人肾小管上皮细胞进行依托泊苷处理后,DAO的表达增加,同时候选基因调控蛋白中的TET2和TP63表达显著上调。使用小干扰RNA(siRNA)敲低TET2或TP63后,DAO的表达显著降低。对DAO基因启动子区域进行亚硫酸氢盐测序后发现,DNA甲基化与DAO表达之间没有显著相关性。这些发现表明TET2和TP63是影响DAO表达的新因子,为D-氨基酸代谢的转录调控机制提供了新的认识。鉴于D-氨基酸在肾脏功能、炎症和癌症中的作用,阐明DAO的调控机制可能有助于开发相关疾病的新型生物标志物和治疗策略。

D-氨基酸氧化酶(DAO)是D-氨基酸代谢中的关键酶,影响着多种生理和病理过程,包括肾脏疾病。然而,调控DAO基因表达的机制在很大程度上仍然未知。在这项研究中,我们通过识别与DAO基因启动子和内含子1区域结合的因素,并评估这些因素对DAO表达的影响,来研究DAO基因的转录调控机制。我们还探讨了DNA甲基化在此过程中的作用。利用ChIP-Atlas和整合基因组学分析,我们发现了20个候选的基因调控蛋白。对HK-2人肾小管上皮细胞进行依托泊苷处理后,DAO的表达增加,同时候选基因调控蛋白中的TET2和TP63表达显著上调。使用小干扰RNA(siRNA)敲低TET2或TP63后,DAO的表达显著降低。对DAO基因启动子区域进行亚硫酸氢盐测序后发现,DNA甲基化与DAO表达之间没有显著相关性。这些发现表明TET2和TP63是影响DAO表达的新因子,为D-氨基酸代谢的转录调控机制提供了新的认识。鉴于D-氨基酸在肾脏功能、炎症和癌症中的作用,阐明DAO的调控机制可能有助于开发相关疾病的新型生物标志物和治疗策略。

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