基于 HILIC-MS/MS 的 GAG 二糖标准化分析工作流程

《Glycobiology》：A practical framework for label-free GAG disaccharide analysis by HILIC-MS/MS: detailed protocols for analysis of diverse biological sample types

摘要

细胞外基质（ECM）和细胞表面糖萼是生物学中的关键组成部分，在发育、组织功能以及疾病过程中发挥着重要作用。蛋白聚糖及其糖胺聚糖（GAG）侧链是ECM和糖萼的重要组成部分。GAG能够与多种蛋白质（如趋化因子）结合，并在细胞周围形成水化屏障。现有的和新方法正在帮助我们更深入地了解GAG在生物学中的作用。在此，我们基于这些技术，提出了一个流程化、标准化且文档齐全的端到端工作流程，用于GAG二糖的分析，该流程可以在标准分析设施中轻松应用于多种生物学样本类型的分析。提供了关于样本处理、从生物样本中提取GAG二糖以及HILIC-MS/MS分析的详细步骤指导。此外，我们还展示了该工作流程在多种低量生物样本中的广泛应用，包括细胞沉淀物、FACS分选的细胞、冷冻组织、FFPE切片、血清和粘液洗涤液等。通过补充现有的和新兴的分析方法，这一工作流程促进了GAG二糖分析的更广泛采用，并便于研究不同生物系统中的GAG功能。该方法将与现有和新技术共同发挥作用，帮助提高GAG分析的可获取性，从而进一步推动人们对复杂生物环境中GAG功能的研究。