摘要
背景：非综合征性唇裂和/或腭裂（NSCL/P）是亚洲常见的先天性颅面畸形，对面部美观和发育健康有严重影响。遗传咨询可以支持家庭咨询和风险评估，但针对中国人群的实际靶向方法仍然有限。方法：我们基于唾液开发了一个靶向捕获测序面板，用于检测与NSCL/P相关的变异，这些基因是从东亚的全基因组关联研究和已发表的文献中选取的。该面板包括116个基因/位点和77,179个生物素化的100 bp探针。在16例NSCL/P患者和10例未受影响的对照组组成的回顾性试点队列中，初步评估了该技术的可行性。唾液提取的DNA经过文库构建、液相杂交捕获、Illumina测序，并使用GATK和VEP进行变异注释。结果：所选基因涵盖14个功能类别，包括细胞代谢、神经发育和关键信号通路（SHH、WNT和TGF-β）。在16例NSCL/P患者中有13例（81.3%；95% CI 54.4–96.0%）发现了非同义变异，而在10例未受影响的对照组中未发现任何符合条件的非同义变异（0.0%；95% CI 0.0–30.8%）。在报告的22个外显子变异中，20个（90.9%）是单核苷酸变异。PTCH1占22个变异中的6个（27.3%）。结论：这项探索性试点研究提供了初步证据，支持基于唾液的靶向捕获测序技术在检测中国试点队列中NSCL/P相关变异方面的技术可行性。探针定制后的相对较低测试成本表明该方法有可能应用于更大的样本队列。然而，由于样本量较小，这些发现的普遍性受到限制，其分析性能、诊断效率、临床益处和正式的成本效益仍需通过更大规模的独立前瞻性研究来证实。
