摘要
非洲猪瘟病毒(ASFV)可以说是对全球食品安全最严重的威胁之一。其死亡率接近100%,威胁着猪肉生产,而猪肉是人类营养的重要组成部分,占全球肉类消费量的35%以上。ASFV也是结构最复杂、体积最大的病原病毒之一,其基因组大小为170-190千碱基对。为了更好地了解这种病毒,我们使用三种基于细菌的检测方法对HK_NT_202103株的基因组进行了全面的离子通道筛查。在筛查的196个基因中,有24个基因表现出跨膜传导能力,并通过麦芽糖结合蛋白融合和Western blotting技术验证了它们的表达和整合情况。其中14个基因在所有三种检测方法中均呈阳性反应,确认它们具有潜在的病毒通道蛋白(viroporin)功能。这组功能冗余的病毒通道蛋白使病毒能够调节宿主细胞的钾离子水平和质子转运。除了识别一般的离子通道外,我们还确定了特定的质子选择性孔道。通过应用动力学建模和三元聚类分析,我们根据这些离子通道的特异性离子转运特性,将它们分类到不同的功能区。对全球11种不同基因型的基因组比较显示,这些关键离子通道在过去一个多世纪里几乎没有发生变化。结构稳定性和功能关键性的结合使得这些离子通道成为治疗干预的主要靶点。最终,这项研究提供了首个经过验证的ASFV离子通道功能图谱,为设计针对病毒代谢核心的广谱抗病毒药物提供了详细的路径。






