欧洲神经退行性疾病平台（EPND）队列脑脊液蛋白质组学分析：阿尔茨海默病、路易体痴呆和帕金森病的特异性及共同变化

《Alzheimer's Research & Therapy》：The EPND cohort: study design and CSF proteomics across ?Alzheimer’s disease, dementia with Lewy bodies, and Parkinson’s disease

摘要

引言

阿尔茨海默病（AD）、路易体痴呆（DLB）和帕金森病（PD）的治疗方法开发受到对疾病特异性及共同病理生理机制理解不足的阻碍。目前，涵盖AD、DLB和PD的研究队列中同时包含多种既定病理学特征和广泛分子过程的标准化体内生物标志物的样本非常有限，这限制了不同疾病之间的比较。因此，我们建立了欧洲神经退行性疾病平台（EPND）队列。本文将介绍该队列的设计和方法，并探讨了这些疾病中脑脊液（CSF）蛋白质组学的特异性和共同变化。

方法

为了构建EPND队列，我们从十个欧洲研究队列中选择了患有AD、DLB、PD的参与者或对照组。样本在中心实验室进行了分析。通过Elecsys检测了CSF和血浆中的β-淀粉样蛋白（Aβ）42、Aβ40、磷酸化tau蛋白（p-tau）181和神经丝轻链；同时使用Milliplex技术检测了CSF中的总α-突触核蛋白。此外，还在CSF（Milliplex）和血浆（SVAR）中进行了补体检测，并使用Olink Explore 3072和SomaScan 7k蛋白组学面板对CSF进行了分析。队列的相关人口统计学、临床信息、认知能力、评分量表、生活方式、遗传学和关键影像学数据均进行了集中标准化处理。通过这个队列，我们使用Olink邻近延伸测定法发现了在不同疾病中独特或共同失调的CSF蛋白（n = 1617种）。数据分析时考虑了年龄、性别和平均CSF蛋白水平（所有高度检测到的Olink蛋白的平均z分数）等因素，并对P值进行了FDR校正。

结果

EPND队列共纳入了353名参与者（平均年龄67.1岁，标准差9.2岁，其中133名为女性，占比38%）：151人患有AD，67人患有DLB，75人患有PD，57人为对照组，3人患有其他疾病。样本分析和数据标准化后产生了五个数据集，可通过EPND目录申请用于研究再利用。对其中325名参与者的探索性蛋白质组学分析显示，某些CSF蛋白在AD（n = 9种）、DLB（n = 1种）或PD（n = 2种）中特异性失调；还有部分蛋白在AD和DLB（n = 10种）以及DLB和PD（n = 4种）中存在类似失调，但在AD和PD中未观察到这种共同失调现象。

结论

EPND队列为神经退行性疾病研究提供了宝贵的资源，涵盖了AD、DLB和PD，采用了集中测量的靶向和高通量生物标志物。该队列可通过EPND目录供研究机构重新使用，有助于促进跨神经退行性疾病的协作研究。目前和未来的研究结果将为理解疾病特异性及共同病理生理机制提供依据，并为试验设计提供参考。