基于单细胞分析揭示胰腺癌 C8 状态及构建 KRT 标记预后评分系统

《BMC Cancer》：Development and multicohort evaluation of a KRT5/KRT6A/KRT17-based prognostic scoring system for pancreatic cancer using single-cell RNA sequencing

【字体：大中小】 时间：2026年11月13日 来源：BMC Cancer 4.1

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摘要

背景

由于胰腺癌（PACA）发病隐匿且缺乏有效的分层工具，其预后仍然不佳，这突显了迫切需要一个优化的预后评分系统。

方法

我们使用了CRA001160单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集（24个PACA样本）进行单细胞分析。共有来自四个独立队列的913个宏观样本被纳入用于预后评分的开发和多队列评估。还利用组织微阵列（TMA，n = 80）进行了多重免疫荧光实验，以验证我们的预后评分系统的性能。

结果

对CRA001160中的恶性细胞进行分析后发现了一种C8恶性细胞状态，这种状态与增殖和干细胞相关的一系列特征有关，这些特征的丰度在不同的TNM分期中都有所增加。在所有宏观队列中，与C8相关的特征与较差的生存率以及经典的肿瘤抑制基因TP53和CDKN2A的突变状态相关。我们利用C8恶性细胞的三个标志物开发并评估了一个新的预后评分系统，该系统显示出了不同的生存结果。TMA和四个独立的转录组队列的结果显示出一致的预后相关性，支持在独立数据集和不同的检测类型中进行进一步验证。

结论

我们的发现提供了关于PACA肿瘤内异质性的见解，并展示了单细胞分析在预后生物标志物开发方面的潜力。基于KRT5/KRT6A/KRT17的评分系统在回顾性队列中显示出预后相关性，但在临床应用之前，需要使用标准化检测方法和预先指定的阈值进行前瞻性验证。

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背景

由于胰腺癌（PACA）发病隐匿且缺乏有效的分层工具，其预后仍然不佳，这突显了迫切需要一个优化的预后评分系统。

方法

我们使用了CRA001160单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集（24个PACA样本）进行单细胞分析。共有来自四个独立队列的913个宏观样本被纳入用于预后评分的开发和多队列评估。还利用组织微阵列（TMA，n = 80）进行了多重免疫荧光实验，以验证我们的预后评分系统的性能。

结果

对CRA001160中的恶性细胞进行分析后发现了一种C8恶性细胞状态，这种状态与增殖和干细胞相关的一系列特征有关，这些特征的丰度在不同的TNM分期中都有所增加。在所有宏观队列中，与C8相关的特征与较差的生存率以及经典的肿瘤抑制基因TP53和CDKN2A的突变状态相关。我们利用C8恶性细胞的三个标志物开发并评估了一个新的预后评分系统，该系统显示出了不同的生存结果。TMA和四个独立的转录组队列的结果显示出一致的预后相关性，支持在独立数据集和不同的检测类型中进行进一步验证。