2024年关于中医诊断方法理论研究的综述

《Guidelines and Standards in Chinese Medicine》：A review of theoretical research on traditional Chinese medicine diagnostic methods in 2024

CuE通过PFSC预测并实验验证调控炎症、免疫及肿瘤相关靶点如STAT3、IL-6，证明PFSC有效用于TCM多靶点分析。

　　

摘要 通俗语言总结

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背景：

中医（TCM）是一个复杂的系统，包含众多化学成分，这些成分协同作用产生治疗效果。然而，中医化合物的分子靶点尚不明确，这对该领域的现代研究构成了重大挑战。葫芦素E（CuE）是一种从中医植物中提取的四环三萜类化合物。先前的研究表明，它具有抑制癌细胞增殖和减轻炎症反应的作用，但其具体靶点仍不清楚。

方法：

在这项研究中，我们使用了一种新的生物信息学工具——蛋白质折叠形状代码（PFSC）来全面分析CuE的蛋白质靶点。PFSC旨在表征蛋白质的三维（3D）折叠结构。随后，我们利用基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对预测的靶点进行功能注释和通路分析。此外，这些预测的有效性通过逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR）得到了实验验证。

结果：

通过对PDBeChem数据库的搜索，发现了四种与CuE相似度超过80%的化合物。基于这一分析，预测CuE可能与2VDY和3TC5这两种蛋白质结构发生相互作用。进一步筛选后，发现了10多个高分的蛋白质靶点，这些靶点参与了炎症、血管生成和免疫调节等过程。从这些靶点中，选择了8个特定的靶点（PIN1、PPARG、FGFR1、BRAF、JAK1、JAK3和IL-6）进行实验验证。细胞水平实验结果表明，CuE能够调节这些靶点的基因表达水平。

结论：

本研究结果表明，PFSC是一种非常有效的分析蛋白质三维结构的方法，非常适合用于识别中医化合物的多个靶点。

通俗语言总结：本研究探讨了葫芦素E（CuE）的分子靶点。CuE是一种具有抗癌和抗炎特性的中医化合物。研究人员使用了一种名为蛋白质折叠形状代码（PFSC）的生物信息学工具来预测CuE的蛋白质靶点，发现了与炎症、血管生成和免疫调节相关的蛋白质结构。通过RT-qPCR实验验证，确认了包括PIN1和STAT3在内的8个靶点受到CuE的影响。该研究凸显了PFSC在识别中医化合物多个靶点方面的有效性，从而加深了我们对这些化合物作用机制的理解。