基于质谱的非靶向代谢组学方法测定的Megachile rotundata在蛹期各阶段的代谢组变化

《Insect Biochemistry and Molecular Biology》:Metabolome Changes of Megachile rotundata Across Pupal Stages Measured by Mass Spectrometry-Based Untargeted Metabolomics

【字体: 时间:2026年02月12日 来源:Insect Biochemistry and Molecular Biology 3.7

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  代谢组学分析显示,蒙古蓝切叶蜂(Megachile rotundata) prepupae(PP)、红眼蛹(RE)、黑化蛹(ME)三个发育阶段代谢谱存在显著差异,其中RE与ME阶段间差异代谢物达70种,主要涉及氨基酸、神经递质、磷酸化碳水化合物等,表明蛹期发育中代谢活性随阶段推进显著增强。性别间代谢谱无显著差异。研究采用GC-MS技术结合OPLS-DA模型,首次系统解析了该独居蜂发育阶段的代谢动态特征。

  
Banani Mondal | Rikki Walter | Joseph P. Rinehart | Kendra J. Greenlee | Franco Basile
怀俄明大学化学系,拉勒米,怀俄明州

摘要

通过对苜蓿切叶蜂(Megachile rotundata)的雄性和雌性个体在三个发育阶段(预蛹期(PP)、红眼蛹期(RE)和黑色素化蛹期(ME)进行气相色谱-质谱(GC-MS)非靶向代谢组学分析,研究了其代谢变化。研究重点关注极性代谢物的分析,结果发现了M. rotundata这三个发育阶段之间的明显代谢差异。然而,在每个发育阶段内,雄性和雌性的代谢谱型没有显著差异。在研究的三个蛹期中,共鉴定出189种代谢物,并利用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)建立了这些数据与观察结果(发育阶段或性别)之间的关系。具体而言,在PP阶段与RE阶段之间有50种代谢物发生显著变化;而在RE阶段与ME阶段之间,有70种代谢物发生显著变化(OPLS-DA判别标准为VIP > 1且组间倍数变化值 > 1.5),这表明随着发育阶段的推进,代谢活性增强。与不同发育阶段相关的代谢物包括氨基酸、神经递质、碳水化合物及其衍生物(磷酸化物、氨基化合物、醇类)、核苷酸和有机酸)。测得的相对代谢物水平可以根据每个发育阶段的代谢活动进行合理解释。PP阶段的特征是整体能量消耗较低,主要涉及通过蛋白质降解产生的氨基酸的代谢;而ME阶段的特征是与黑色素化过程相关的代谢物(酪氨酸、DOPA)以及磷酸化碳水化合物、氨基酸、核酸和神经递质的水平较高,表明该阶段能量消耗较高且发生结构变化。

引言

传粉者对于维持生态系统的完整性和多样性至关重要(IPBES, 2016),传粉者的减少会导致影响人类生存的作物产量下降。Megachile rotundata是美国重要的苜蓿(Medicago sativa)传粉者,引入后作物产量可从每公顷450公斤增加到1300公斤(Pitts-Singer和Cane, 2011a)。尽管M. rotundata是一种独居蜜蜂,但它可以作为蜜蜂的替代品用于多种作物的授粉(Richards, 1995),例如洋葱种子、胡萝卜、杂交油菜、豆类、低矮蓝莓、一年生三叶草和温室作物。作为有前景的替代传粉者,其成功应用依赖于适当的管理(Pitts-Singer和Cane, 2011a)。与蜜蜂不同,M. rotundata在苜蓿作物上的觅食更为可靠,并且可以以滞育的预蛹形式越冬。为了理解其发育机制,对处于不同发育阶段的蜜蜂进行适当的分期研究是必要的。虽然这种蜜蜂各发育阶段的生理学和形态学特征已经得到充分研究(Helm等人, 2018a),但作为传粉者所具有的关键代谢过程尚未得到广泛研究。深入了解与每个生理阶段相关的代谢过程有望为这些传粉者的管理提供新的见解。然而,关于M. rotundata的代谢组学信息仍然非常有限。
通过代谢组学研究可以确定代谢组的组成,从而帮助从分子水平上理解这种传粉者的生理变化。气相色谱-质谱(GC-MS)和液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术能够同时测量生物样本中的数百种代谢物分子,这就是所谓的非靶向代谢组学(Cajka和Fiehn, 2016;Di Minno等人, 2021)。在基于质谱的非靶向代谢组学研究中,样本制备和分析工作流程都经过优化,以全面提取、检测和注释(鉴定)生物样本中的多种内源性代谢物,包括但不限于氨基酸、碳水化合物和脂质。基于质谱的非靶向代谢组学已成功应用于食品科学(Pinu, 2016)、医学科学(Shajahan-Haq等人, 2015)、农业(Dixon等人, 2006)和微生物学(Vernocchi等人, 2016)领域。非靶向代谢组学通常被认为是一种发现驱动的方法,其测量目的是比较同一生物样本在不同状态(如健康与患病个体、不同发育阶段或不同环境压力下的状态)之间的整体代谢组成。许多代谢组学研究集中在蜜蜂、花粉和其他模式昆虫上(Furse等人, 2023;Horvath等人, 2021;Keaveny等人, 2023;Snart等人, 2015)。在一项针对蜜蜂的研究中,GC-MS代谢组学用于揭示健康蜜蜂与患病蜜蜂之间的代谢物差异(Aliferis等人, 2012),发现健康蜜蜂中的果糖、山梨醇、甘油和脯氨酸含量较高。另一项研究利用GC-MS代谢组学和脂质组学比较了四种饮食和热生态不同的蜜蜂物种的脂肪酸组成(Giri等人, 2018)。此外,GC-MS还被用于研究独居雌蜂的角质层脂质,发现其主要成分是碳氢化合物(Buckner等人, 2009)。大多数关于昆虫的研究采用靶向代谢组学方法,而采用非靶向方法预计可以更广泛地检测代谢物,无论是数量还是种类。
尽管基于质谱的代谢组学在蜜蜂研究中有广泛应用,但文献中关于M. rotundata脂质谱的研究仍然较少(Buckner等人, 2009;Giri等人, 2018),且没有研究探讨该物种的完整代谢组组成。为了更好地了解M. rotundata在重要发育阶段的代谢组,我们采用了基于高分辨率质谱(HR-MS)的非靶向代谢组学和脂质组学方法来测量这种蜜蜂不同发育阶段和性别的代谢组。我们最初试图验证雄性和雌性预蛹的代谢组存在差异的假设,但结果未发现两者之间存在明显差异。另一方面,对三个生命阶段的测量揭示了代谢组的动态化学组成,并推断出每个蛹阶段的代谢途径。

化学物质和材料

溶剂甲醇(MeOH,Optima?级)、水(Optima?级)和甲基叔丁基醚(MTBE;HPLC级)购自Fisher Chemical(美国马萨诸塞州沃尔瑟姆)。乙酰氯(≥99%)购自Sigma Aldrich(美国密苏里州圣路易斯),正己烷(99%)购自Alfa Aesar(美国马萨诸塞州沃德希尔),吡啶(99.5%)购自Thermo Fisher(美国马萨诸塞州沃尔瑟姆)。N-甲基-N-(三甲基硅基)三氟乙酰胺(MSTFA)(>98.5%)购自Sigma Aldrich(美国密苏里州圣路易斯),碳酸钾(ACS级)也购自同一公司。

M. rotundata的代谢组学分析

通过对三个发育阶段的提取物进行GC-MS分析,共检测到613个独特的色谱特征。这些特征包括衍生化的代谢产物(已注释和未知)和背景信号。图1显示了ME阶段和PP阶段获得的色谱图之间的比较。从这些数据可以看出,ME阶段的色谱峰或特征数量明显多于PP阶段。

讨论

代谢组测量

M. rotundata在蛹期发育过程中的代谢组进行测量(图3和图4)表明,这三个阶段之间的代谢状态非常动态。从火山图和图8的热图可以看出,在RE阶段向ME阶段过渡期间,代谢活性显著增加。ME阶段的特征是氨基酸、神经递质、核酸和碳水化合物的水平升高,反映了这一时期的代谢变化。

结论

本文详细描述了苜蓿切叶蜂M. rotundata在三个蛹期发育阶段的代谢组变化,揭示了其动态的代谢组成。基于GCMS的非靶向代谢组学成功检测并鉴定了这些阶段的关键代谢物,包括氨基酸、神经递质和碳水化合物。代谢组组成的最大变化(以及/或最显著的……)

CRediT作者贡献声明

Kendra J. Greenlee:写作——审稿与编辑、资源管理、方法学设计、实验设计、资金申请、数据分析、数据管理、概念构思。Joseph P. Rinehart:资源管理、方法学设计、实验设计、数据管理。Franco Basile:写作——审稿与编辑、数据可视化、项目监督、方法学设计、实验设计、数据分析、概念构思。Rikki Walter:资源管理、方法学设计、实验设计、概念构思。Banani

致谢

本研究得到了美国国家科学基金会RII Track-2 FEC:昆虫低温生物学和生态生理学网络(NSF资助编号:1826834)以及美国农业部农业研究服务局(USDA-ARS)58-3060-9-032的支持。
本文的发现和结论仅代表作者的观点,不应被视为美国农业部或美国政府的任何官方决定或政策。本文中提到的商品名称或商业产品仅用于……
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