巴黎地区西尼罗病毒的基因组流行病学研究

《JAMA Network Open》：Genomic Epidemiology of West Nile Virus in Paris

西尼罗病毒（WNV）在法国2022-2025年时空传播动态及2025年巴黎暴发溯源研究表明，仅检出谱系2病毒，通过系统发育分析揭示2025年巴黎病毒源自2023-2024年南大西洋地区流行毒株，证实病毒扩散依赖本地维持与跨区域长距离传播双重机制。

　　

要点

问题 西尼罗河病毒（WNV）在法国的空间和时间动态如何？2025年巴黎地区疫情爆发的病毒谱系是什么？

研究结果 这项研究于2022年至2025年间进行，整合了法国范围内的人类、兽医和昆虫学监测数据。在分析的52个WNV阳性样本中，仅检测到2谱系。系统发育分析表明，地中海地区的病毒株与往年南大西洋地区的病毒株有关，并发现2025年巴黎疫情的病毒株也来源于南大西洋亚谱系。

意义 这些结果表明，WNV在法国的传播既依赖于局部病毒的持续存在，也依赖于跨地区的远距离传播，这强调了加强基因组监测以预测未来疫情爆发的必要性。

摘要

重要性 西尼罗河病毒（WNV）是一种由蚊子传播的正黄病毒，对欧洲的公共卫生构成了日益严重的威胁。2025年7月，WNV 2谱系（WNV-L2）与法国巴黎大都会区首次发现的本土病例相关联；了解这些疫情爆发的传播动态和地理起源对于公共卫生准备至关重要。

研究目的 研究旨在描述2022年至2025年间WNV在法国的空间和时间动态，并确定导致2025年巴黎大都会区疫情爆发的病毒谱系。

研究设计、地点和参与者 本研究采用基因组流行病学方法，结合了人类、兽医和昆虫学监测数据，以及病毒基因组测序和基于贝叶斯理论的系统发育分析。监测范围覆盖了整个法国大都会区，重点关注有WNV传播记录的地区（东地中海、西地中海、南大西洋和巴黎）。监测对象包括确诊WNV感染的患者、禽类和马匹病例以及蚊子样本。

暴露因素 在受影响地区通过蚊子媒介自然暴露于WNV。

主要结果和指标 利用贝叶斯方法推断法国各地区疫情事件之间的系统发育关系。

结果 这项流行病学评估的基因组数据包括52个WNV阳性样本（6个人类样本、21个兽医样本和25个昆虫学样本）。2022年至2025年间，法国仅检测到WNV-L2谱系。2024年，西地中海地区的病毒株与2023年南大西洋地区的病毒株密切相关，表明病毒是从西部向南部传播的；而东地中海地区的病毒株在基因上属于与意大利北部相关的不同分支。2025年巴黎地区WNV序列的系统发育分析显示，疫情爆发的病毒株均属于2023至2024年间南大西洋地区的L2谱系。

结论和相关性 这项研究通过52个WNV阳性样本的基因组数据表明，WNV在法国的传播受到局部病毒持续存在和远距离传播的共同影响。加强跨越生态和行政边界的基因组监测对于预测病毒进一步传播、制定应对策略以及保护高风险人群至关重要。