在引入Rotavac?疫苗后，内罗毕城市非正式定居点中儿童轮状病毒性胃肠炎的流行情况及其分子流行病学特征

《Tropical Medicine and Health》：Prevalence and molecular epidemiology of rotavirus gastroenteritis among children in Nairobi’s urban informal settlements following introduction of the Rotavac? vaccine

轮状病毒仍是肯尼亚内罗毕贫民窟儿童胃肠炎的主要病原体，疫苗接种后感染率显著下降（74.1%有效性），但检测到G2、G12及新型G2P8、G12P8毒株，需加强分子监测。

　　

摘要

背景

在全球范围内，轮状病毒是5岁以下儿童急性胃肠炎的主要原因。肯尼亚于2014年开始使用Rotarix?（G1P[8]）疫苗进行轮状病毒疫苗接种，随后在2023年转为使用Rotavac?（G9P[11]）疫苗。关于疫苗接种后肯尼亚的轮状病毒疾病负担、病毒株多样性以及Rotavac?疫苗有效性的数据仍然有限。本研究评估了在Nairobi城市贫民区中，5岁以下儿童在接种Rotavac?疫苗后轮状病毒性胃肠炎的发病情况以及该疫苗的有效性。

方法

在这项横断面监测研究中，2023年10月至2024年11月期间，从Nairobi Mukuru非正式定居点选定的医疗机构中收集了353份5岁以下患有急性胃肠炎的儿童的粪便样本。这些样本通过TaqMan阵列卡PCR和多重半嵌套RT-PCR技术进行了分析。疫苗的整体效果以及Rotavac?疫苗的具体效果是通过事后阴性病例对照分析来估计的。

结果

在353份样本中，有19.5%（69/353；95%置信区间15.5–24.1%）检测到了轮状病毒。12–23个月大的儿童中轮状病毒的检出率最高，为24.4%（30/123；95%置信区间17.1–33.0%），不同年龄组之间存在显著差异（p = 0.023）。接种疫苗的儿童中轮状病毒的流行率为18.4%（60/327；95%置信区间14.3–23.0%），而未接种疫苗的儿童中这一比例为34.6%（9/26；95%置信区间17.2–55.7%）（p = 0.044）。主要流行的病毒株是G2P[4]（29.0%；20/69），在接种疫苗的儿童中也占主导地位（31.7%；19/60），而在未接种疫苗的儿童中G12P[6]最为常见（33.3%；3/9）。新发现的病毒株包括G2P[8]和G12P[8]，以及两种类似马的病毒株（G3P[8]eG3和G2G3P[4]P[8]eG3）。大多数病毒株属于短电泳型。第一剂疫苗的接种率为92.6%（327/353），最后一剂的接种率为76.2%（269/353）。估计Rotavac?疫苗的有效率为74.1%（95%置信区间16.3–92.0%），整体轮状病毒疫苗的有效率为57.6%（95%置信区间18.1–99.8%）。

结论

轮状病毒仍然是Nairobi城市非正式定居区儿童胃肠炎的重要原因。多种多样且不断出现的病毒株的传播强调了持续进行分子监测的必要性，以便监测疫苗的效果并指导未来的免疫策略。