结直肠癌中的功能性微生物群变化及其与宿主微生物组的相互作用：基于宏蛋白质组学方法的见解

《BMC Microbiology》：Functional microbial shifts and host-microbiome crosstalk in colorectal cancer: insights from a metaproteomic approach

　　

摘要

在许多低收入和中等收入国家，包括埃及，结直肠癌（CRC）的发病率正在上升，这在一定程度上是由于城市化和生活方式的改变所致。在这些地区，宏蛋白质组学方法尚未得到充分应用。在这项研究中，我们对埃及的CRC患者进行了粪便宏蛋白质组学分析，以表征与疾病相关的蛋白质表达模式，探讨宿主与微生物群之间的功能相互作用，并识别在CRC肠道环境中发生改变的代谢途径。我们分析了10名CRC患者和10名健康对照者的粪便样本。共鉴定出441种差异表达蛋白（DEPs），其中406种蛋白在倍数变化分析、Wilcoxon检验和PLS-DA方法中均得到一致结果。微生物蛋白的差异表达主要与核心代谢功能相关，包括碳水化合物、氨基酸和核苷酸的转运。值得注意的是，Segatella copri菌属的蛋白质在CRC患者中显著减少。功能分析显示，与DPP-4和半胱氨酸代谢相关的微生物蛋白表达上调，这表明微生物组来源的酶可能在结直肠癌相关的代谢和免疫调节中发挥作用，但尚未发现宿主细胞对这些酶的直接转运证据。