《Acta Pharmacologica Sinica》:Cannabidiol inhibits both human KV7.1 and KV7.1/KCNE1 channels through distinct sites
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《Acta Pharmacologica Sinica》期刊推荐:电压门控钾离子通道KV7家族是重要的药物靶点,但开发亚型选择性化合物以防止副作用是巨大挑战。本研究发现,抗癫痫药物大麻二酚(CBD)可分别通过独特的S5–S6和S6–S5’–E1位点抑制心脏相关KV7.1和KV7.1/KCNE1通道,而对神经元KV7亚型起激活作用。该工作利用人工智能预测、分子对接、分子动力学模拟和位点定向诱变电生理学等技术,揭示了CBD发挥抑制效应的分子机制,为设计选择性KV7通道调节剂提供了关键结构见解,有望指导心血管及神经系统疾病治疗药物的理性开发。
在心脏平稳跳动的背后,一场精密的分子“交响乐”正在上演。心脏肌细胞的“复极”过程——即每次收缩后恢复静息状态——离不开钾离子通道的精密调控。其中,由KV7.1蛋白(由KCNQ1基因编码)和辅助亚基KCNE1共同构成的KV7.1/KCNE1通道复合物,产生缓慢延迟整流钾电流(IKs),是心脏复极的关键“指挥家”。这个通道一旦“失灵”,无论是功能过强还是过弱,都可能导致致命的心律失常。因此,它成为了药物研发的重要靶点。然而,一个核心难题横亘在科学家面前:KV7家族共有五个成员(KV7.1–7.5),它们结构相似,但功能各异——KV7.1/KCNE1主要在心肺和上皮组织表达,而KV7.2–7.5则在神经系统发挥重要作用。开发只作用于特定亚型、避免“误伤”其他成员的药物,犹如大海捞针,极具挑战性。历史上,广谱抗癫痫药瑞替加滨就曾因对非神经KV7通道的副作用而撤市,这凸显了亚型选择性的极端重要性。
在此背景下,一种天然化合物——大麻二酚(Cannabidiol, CBD)走入了研究者的视野。CBD是一种泛KV7调节剂,有趣的是,它对不同家族成员“区别对待”:既往研究表明,它能激活神经元KV7.2–7.5通道,却抑制心脏和上皮相关的KV7.1和KV7.1/KCNE1通道。这种“一药双效”甚至“反向作用”的特性,使其成为理解KV7亚型选择性机制的绝佳“分子探针”。然而,CBD究竟是如何“锁住”KV7.1和KV7.1/KCNE1并使其“关闭”的?其精确的结合位点一直是个未解之谜。这个知识缺口限制了人们基于结构理性设计亚型选择性药物的能力。为了解决这一问题,一个国际研究团队开展了一项多技术融合的深入研究,相关成果发表在《Acta Pharmacologica Sinica》上。
研究者们运用了一套组合技术来“定位”CBD的结合位点并理解其作用机制。首先,他们利用人工智能模型Chai-1预测了CBD在人类KV7.1和KV7.1/KCNE1通道中的潜在结合位点。接着,通过分子对接和分子动力学(MD)模拟,进一步精炼了结合模式并评估了其稳定性。为了验证计算预测,他们在非洲爪蟾卵母细胞中表达了野生型和定点突变的通道,并采用双电极电压钳技术进行电生理学测量,精确量化CBD对通道功能的影响。最后,通过序列比对和结构分析,揭示了不同KV7亚型间结合位点的关键差异。
研究结果
CBD被预测结合于KV7.1和KV7.1/KCNE1的孔道结构域
Chai-1模型预测显示,CBD在KV7.1中主要结合在每个亚基内部的S5–S6跨膜螺旋之间,这个位点被称为S5–S6位点。而在KV7.1/KCNE1复合物中,KCNE1亚基的加入创造了一个全新的结合位点,该位点位于两个相邻KV7.1亚基(其中一个的S6螺旋和另一个的S5’螺旋)与一个KCNE1亚基的夹缝中,因此被命名为S6–S5’–E1位点。与通道激活剂ML277的竞争实验表明,CBD与ML277在KV7.1上竞争相同的结合口袋。
KV7.1的诱变研究证实了S5–S6位点中CBD的相互作用残基
电生理学实验验证了预测。在KV7.1中,将S5螺旋上的G272突变为半胱氨酸(G272C)或S6螺旋上的A336突变为甘氨酸(A336G),均显著减弱甚至完全消除了CBD对通道最大电导(GMax)的抑制作用。此外,位于S5螺旋、预测与CBD存在π-π堆积作用的F275突变为丙氨酸(F275A)后,虽然不影响CBD对GMax的抑制,但诱导了电压依赖性激活(V50)的显著正移,这在野生型中未见。这些结果支持G272、A336和F275是KV7.1中CBD结合和功能效应的关键残基。而位于预测的S6–S5’–E1位点附近的突变(如S338A)则不影响KV7.1对CBD的响应。
KV7.1/KCNE1的诱变研究证实CBD主要与S6–S5’–E1位点的残基相互作用
在KV7.1/KCNE1复合物中,情况发生了变化。将KV7.1的S338突变为丙氨酸(S338A)反而增强了CBD的抑制效力;而将其突变为空间位阻更大的色氨酸(S338W)则完全阻断了CBD的抑制效应,甚至出现了轻微的激活。同样,将KCNE1亚基上与CBD存在疏水作用的F53或F57突变为丙氨酸,也增强了CBD的抑制效力。这些数据表明,S338以及KCNE1的F53和F57是KV7.1/KCNE1复合物中CBD结合和功能的关键残基。有趣的是,在KV7.1/KCNE1背景下,位于S5–S6位点的G272C突变不再影响CBD对GMax的抑制,而A336G突变则完全消除了抑制,提示在复合物中CBD的作用机制更为复杂。
分子动力学模拟揭示了CBD结合模式的稳定性及结合口袋的动态变化
对预测结合模式进行的分子动力学模拟显示,从分子对接获得的CBD构象在KV7.1和KV7.1/KCNE1中均比从Chai-1预测的构象更为稳定。模拟分析揭示了两个结合位点的结构差异:KV7.1中的S5–S6位点是一个相对较浅的开口口袋,而KV7.1/KCNE1中的S6–S5’–E1位点则更深,并由KV7.1的F335和KCNE1的F53像“盖子”一样部分覆盖。更重要的是,模拟发现当CBD结合于KV7.1/KCNE1的S6–S5’–E1位点时,会导致S5和S6螺旋之间的距离缩小,从而“关闭”了KV7.1中固有的S5–S6结合位点。这解释了为何在复合物中,CBD主要依赖S6–S5’–E1位点发挥作用。
序列和结构比较阐明了CBD对KV7亚型的选择性
通过与已解析的CBD结合KV7.2结构进行比较,研究者发现KV7.1/KCNE1中的S6–S5’–E1 CBD结合模式,与KV7.2结构中“下方”的CBD分子以及经典激活剂瑞替加滨的结合位点存在重叠。然而,KV7.1中独特的L266和F335残基在空间上阻碍了CBD以KV7.2的方式结合。序列比对进一步显示,构成KV7.1 S5–S6位点关键的G272和A336残基,在其他KV7亚型中被更大或不同的残基所取代,这可能是CBD的S5–S6结合模式为KV7.1所特有的原因。而KCNE1亚基的引入,通过其F53等残基,在KV7.1/KCNE1中“重建”了一个类似于神经元KV7中瑞替加滨/CBD结合位点的口袋。
研究结论与意义
本研究通过计算与实验相结合的策略,首次系统阐明了CBD抑制人类KV7.1和KV7.1/KCNE1通道的分子结构基础。核心结论是:CBD通过两个截然不同的位点实现对这两种通道的抑制。在KV7.1同源四聚体中,CBD结合于一个亚基内的、位于S5和S6螺旋之间的口袋(S5–S6位点)。而当KCNE1辅助亚基存在时,其与相邻KV7.1亚基共同形成了一个全新的、位于亚基交界处的结合口袋(S6–S5’–E1位点),CBD转而主要结合于此。分子动力学模拟表明,CBD结合于复合物的S6–S5’–E1位点后,会诱导构象变化,间接“关闭”KV7.1上的S5–S6位点。
这项研究的意义深远。首先,它填补了KV7.1和KV7.1/KCNE1通道药物结合位点信息的空白。这两个位点的发现,为理解CBD为何能对KV7家族产生相反的“抑制”与“激活”效应提供了直接的分子解释。其次,研究揭示了KCNE1亚基不仅调节通道的生物物理特性,还能根本性地改变药物的结合模式,创造了新的药理位点,这加深了我们对辅助亚基在药物作用中角色的认识。最后,也是最重要的,这项研究为基于结构的理性药物设计提供了清晰的“路线图”。研究人员识别出的S5–S6和S6–S5’–E1位点,以及其与神经元KV7中瑞替加滨位点的异同,为药物化学家设计新一代KV7调节剂指明了方向。未来,可以针对KV7.1独特的S5–S6位点设计选择性激活剂以治疗特定心律失常,或设计选择性抑制剂以规避心脏毒性;也可以针对KV7.1/KCNE1特有的S6–S5’–E1界面设计高选择性调节剂。总之,这项工作将CBD从一个“神秘”的泛调节剂,转变为一个揭示KV7通道亚型选择性奥秘的“关键钥匙”,为开发更安全、有效的心血管和神经系统疾病治疗药物奠定了坚实的理论基础。