从福尔马林固定、石蜡包埋的生物标本中通过芯片杂交技术进行诊断的准确性：该队列中的患者主要为肺外分枝杆菌疾病患者

《BMC Microbiology》：Diagnostic accuracy of chip hybridization from formalin-fixed paraffin embedded bioptic specimens in a cohort with predominantly extrapulmonary mycobacterial disease

　　

摘要

引言

肺外结核（TB）和非结核分枝杆菌（NTM）疾病仍然是诊断上的难题，传统的诊断方法（如分枝杆菌培养或分子检测方法，例如GeneXpert）在处理福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）标本时往往效果不佳。在这项研究中，我们评估了从FFPE标本中进行芯片杂交检测的诊断准确性，研究对象主要为肺外分枝杆菌疾病患者。

方法

来自疑似分枝杆菌疾病患者的FFPE标本接受了两种不同的芯片杂交检测（MYCO Direct 1.7和MYCO Chip Vision Array 2.0），同时结合了传统的结核病和NTM疾病诊断方法，包括分枝杆菌培养、分子检测和常规组织学检查。这些不同技术分别从灵敏度、特异性和物种鉴定方面进行了评估。

结果

共有184个样本接受了其中一种芯片杂交技术的检测（MYCO Direct 1.7 n=65，MYCO Chip Vision Array n=119）。这些样本主要为肺外病变（160/184，87.0%）。在所有样本中，有32个样本（17.4%）在芯片杂交检测中呈阳性，74名患者（40.2%）被诊断为具有临床意义的分枝杆菌疾病（59例为结核病，15例为NTM疾病）。对于结核分枝杆菌复合群（MTBC）的检测，其灵敏度为38.9%，与同一标本的分枝杆菌培养结果相比。对于NTM的检测，其灵敏度为50%。物种鉴定结果与常规方法基本一致，但无法区分MTBC复合群或鸟分枝杆菌复合群中的不同物种。

结论

由于肺外结核和NTM疾病仍然是诊断上的难题，所研究的芯片杂交技术可以作为诊断手段的补充。然而，由于其在检测肺外FFPE标本中的结核分枝杆菌时灵敏度较低，这些技术不应取代传统的诊断方法，但可以在无法获取原始标本的情况下用于排除结核病的可能性。