利用多转录组学整合技术解析花生对生物和非生物胁迫的反应

《BMC Plant Biology》：Disentangling Arachis response to biotic and abiotic stress using multi-transcriptomics integration

　　

摘要

背景

花生是人类饮食中的重要豆类作物，但它们同时面临着多种生物和非生物胁迫的影响。根结线虫（RKN）和水分供应不足对这种作物构成了严重威胁。在野生花生品种（如 Arachis stenosperma 和 Arachis duranensis）中已经发现了针对这些胁迫的抗性特征。然而，植物对多重胁迫的响应非常复杂，需要激活相应的信号通路来应对所有胁迫，或者优先处理某一胁迫因素。尽管已有关于野生 Arachis 品种在根结线虫和/或干旱胁迫下的实验数据，但其全局基因组调控网络以及生物与非生物分子机制之间的相互作用尚未完全阐明。

结果

在这项研究中，我们采用了 HIVE（一种整合分析框架）来研究两种野生 Arachis 品种在受到根结线虫 Meloidogyne arenaria 和/或干旱胁迫时的转录反应。通过 HIVE 的分析结果，我们推断出了这两种野生 Arachis 品种对生物和非生物胁迫的全局基因组调控网络。对该基因调控网络的研究有助于识别新的调控机制，特别是那些可能与 M. arenaria 和/或干旱胁迫响应相关的转录因子和信号通路。

结论

我们的研究结果表明，HIVE 的性能优于传统的元分析方法，能够识别出可能负责触发多重胁迫有效防御反应的新候选基因。