优化抗菌预处理后肠杆菌目（Enterobacterales）物种的鉴定方法：一项前瞻性队列研究

《BMC Microbiology》：Optimizing species identification after antimicrobial pretreatment in Enterobacterales: a prospective cohort study

　　

摘要

背景

在采集标本之前开始抗菌治疗会降低细菌培养的回收率，并改变微生物的革兰氏染色形态，但关于这种处理对后续物种鉴定影响的了解却非常有限。这项前瞻性队列研究评估了抗菌预处理对肠杆菌目（Enterobacterales）中密切相关成员的物种鉴定的影响，使用了传统的和自动化的表型分析方法（Vitek 2）以及基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS），从总体准确性和成本效益的角度进行了分析。

结果

共有240株具有明显抗菌预处理效果的肠杆菌目分离株被纳入研究。在初次培养时，使用标准截断值的MALDI-TOF MS方法的成功率较低（75.0% vs 97.3%；P?P?=?1）。Vitek 2自动化系统的准确率与基准值相当。具有预处理效果的分离株中，产生广谱β-内酰胺酶的大肠杆菌（25.2% vs 43.4%；P?肺炎克雷伯菌（9.5% vs 30.6%；P?大肠杆菌（0.7% vs 4.3%；P?=?0.027）和肺炎克雷伯菌（3.2% vs 24.5%；P?

结论

对于具有抗菌预处理效果的分离株，使用降低截断值的MALDI-TOF MS和自动化表型分析方法是成本效益最高且最准确的方法。此外，这种预处理效果可能作为抗菌耐药性较低的早期指标。

背景

在采集标本之前开始抗菌治疗会降低细菌培养的回收率，并改变微生物的革兰氏染色形态，但关于这种处理对后续物种鉴定影响的了解却非常有限。这项前瞻性队列研究评估了抗菌预处理对肠杆菌目中密切相关成员的物种鉴定的影响，使用了传统的和自动化的表型分析方法（Vitek 2）以及基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS），从总体准确性和成本效益的角度进行了分析。

结果

共有240株具有明显抗菌预处理效果的肠杆菌目分离株被纳入研究。在初次培养时，使用标准截断值的MALDI-TOF MS方法的成功率较低（75.0% vs 97.3%；P?P?=?1）。Vitek 2自动化系统的准确率与基准值相当。具有预处理效果的分离株中，产生广谱β-内酰胺酶的大肠杆菌（25.2% vs 43.4%；P?肺炎克雷伯菌（9.5% vs 30.6%；P?大肠杆菌（0.7% vs 4.3%；P?=?0.027）和肺炎克雷伯菌（3.2% vs 24.5%；P?

结论

对于具有抗菌预处理效果的分离株，使用降低截断值的MALDI-TOF MS和自动化表型分析方法是成本效益最高且最准确的方法。此外，这种预处理效果可能作为抗菌耐药性较低的早期指标。