通过景观遗传学方法为南亚极度濒危的黑软壳龟（Nilssonia nigricans）提供保护策略

《Scientific Reports》：Conservation insights for the Critically Endangered Black Softshell Turtle (Nilssonia nigricans) through landscape genetics approach in South Asia

　　

摘要

先进的分子生物学和生态学方法已成为全球公认的、有效的生物多样性保护规划与管理框架。在本研究之前，除了分类学研究外，尚未有过结合遗传学和生态学数据对极度濒危的黑软壳龟（Nilssonia nigricans）进行的全面评估。本研究获得的线粒体COI和CYTB基因数据清晰地区分了N. nigricans与其近缘种，进一步验证了基于形态学的物种鉴定结果。此外，通过未校正的

-距离分析，结合四个线粒体基因（COI、CYTB、ND4和12 S rRNA）以及三个核基因（C-mos、ODC和R35），可以更准确地了解种群间的遗传差异。物种分布模型显示，在当前气候条件下，仅有12.81%（21,127平方公里）的区域适合N. nigricans生存，而连通性分析则指出了其分布范围内四条主要的迁徙通道：特莱地区、西布拉马普特拉河区域、卡齐兰加-丹西里地区以及东布拉马普特拉河区域。在未来的气候情景下，适合该物种生存的地域面积预计将增加64%以上。不过，在所有预测情景下，这些迁徙通道内的连通性都可能会下降。Mantel分析表明，遗传距离与景观阻力之间不存在显著关联，但某些基因位点存在显著的距离隔离现象，这说明地理分离才是导致N. nigricans遗传差异的主要因素。这些特征很可能反映了历史上的种群动态以及人类活动带来的物种迁移，而非当前景观因素对物种连通性的影响。此外，本研究还确定了印度东部和东北部、孟加拉国东北部以及尼泊尔东部的优先保护区域，这些区域对于维持该物种的生存环境至关重要。总体而言，本研究为确定N. nigricans的优先保护区域和潜在重新引入地点提供了新的方法。这些发现有助于制定适应性管理策略，兼顾当前该物种的遗传状况以及未来可能出现的环境变化。