多组学方法评估细胞系作为转移性前列腺癌模型的适用性

《Communications Biology》：Multi-omics evaluation of cell lines as models for metastatic prostate cancer

　　

摘要

细胞系是前列腺癌研究中不可或缺的工具，但它们作为远距离转移模型的适用性尚未得到充分研究。在此，我们利用大规模的公共多组学数据进行了系统评估。研究发现细胞系与转移性患者样本之间存在显著的基因组差异，并确定了那些更接近转移性前列腺癌的细胞系。值得注意的是，高突变率显著影响了肿瘤微环境，这突显了在选择模型时考虑突变负担的重要性。令人惊讶的是，广泛使用的PC3细胞系在转录组学和表观基因组学方面与任何前列腺癌亚型的相似度都较低，揭示了这一此前未被认识到的局限性。此外，我们发现现有的工程化干细胞样细胞系无法准确再现间充质干细胞样前列腺癌的转录组特征，而选定的类器官则具有更高的相似度。我们的研究为转移性前列腺癌研究中的细胞系选择提供了指导，并强调了开发针对间充质干细胞样亚型的改进细胞系的迫切需求。