综述：秀丽隐杆线虫中的邻近标记策略：综述

《Cell Communication and Signaling》：Proximity labeling strategies in Caenorhabditis elegans: a comprehensive review

蛋白质组学中的邻近标记法（PL）为解析线虫（C. elegans）中时空动态的蛋白质互作网络提供了新工具，弥补传统方法如共免疫沉淀和酵母双杂交的不足，支持研究瞬时、弱相互作用及特定细胞区室蛋白网络。本文系统综述了PL技术的原理与应用，包括过氧化物酶基（APX）和生物素连接酶基（BioID、TurboID等）系统，并探讨纳米抗体间接标记等创新技术，分析其实践难点与未来方向，确立PL为解析活体环境中动态蛋白质互作的有效框架。

　　

摘要

蛋白质组学领域因邻近标记（Proximity Labeling, PL）技术的发展而发生了革命性变革，该技术能够实现蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-Protein Interactions, PPIs）的体内定位以及调控蛋白组的特征分析。在模式生物秀丽隐杆线虫（C. elegans）中，邻近标记方法为揭示空间和时间上受调控的蛋白质网络提供了新的机遇。本综述全面概述了邻近标记策略的原理和应用，包括基于过氧化物酶（APX）和基于生物素连接酶（BioID、TurboID、miniTurboID 和 UltraID）的系统在秀丽隐杆线虫研究中的应用。我们重点介绍了这些工具如何克服传统互作组学方法（如共免疫沉淀和酵母双杂交）的局限性，从而能够研究短暂性、弱相互作用以及特定细胞区室中的蛋白质网络。此外，我们还讨论了基于纳米抗体的间接标记等最新创新技术，这些技术提升了邻近标记技术的多功能性和精确度。同时，我们也探讨了实际操作中的注意事项、技术挑战以及未来发展方向，以推动秀丽隐杆线虫中邻近标记技术的发展，从而更全面地理解生物体内的蛋白质功能。总体而言，这些进展使得邻近标记技术成为解析秀丽隐杆线虫生理背景下动态蛋白质相互作用的强大工具。