使用起始密码子靶向（SCoT）和序列相关扩增多态性（SRAP）标记以及某些叶部解剖特征对十六种芸香科植物进行遗传多样性分析

《Plant Molecular Biology Reporter》：Genetic Diversity Analysis Using Start Codon Targeted (SCoT) and Sequence-Related Amplified Polymorphism (SRAP) Markers and Some Leaf Anatomical Traits in Sixteen Rutaceae Taxa

本研究结合形态解剖学与SCoT、SRAP分子标记，分析埃及阿斯旺植物园16种芸香科植物，发现SRAP标记区分能力更强，SCoT作为补充，支持了分类学结论和保育策略制定。

　　

摘要

将解剖学数据与可靠的分子标记相结合，对于理解芸香科（Rutaceae）内的分类关系至关重要，尤其是对于那些亲缘关系密切的栽培植物而言。本研究利用叶片形态解剖特征，结合起始密码子靶向（SCoT）和序列相关扩增多态性（SRAP）标记，旨在评估从阿斯旺植物园收集的16个芸香科分类单元（11个属）的遗传多样性和分类差异（2023–2024年）。叶片表皮和内部结构分析在芸香科分类鉴定中的诊断价值得到了这些分析中明显存在的种间差异的支持。从定量角度来看，许多特征（包括维管束特征、表皮厚度和叶肉组织结构）表现出一致的模式，这些模式有助于区分不同的谱系。通过分子分析进一步阐明了这些分类单元之间的遗传联系。五种SRAP引物组合产生了12条带，其多态性水平显著更高，达到70%；而七种SCoT引物组合产生了18条可重复的条带，其中32.14%具有多态性。这种差异通过遗传多样性指数得到了进一步体现：与SCoT相比（其PIC值为0.25，MI值为0.46），SRAP的平均PIC值为0.37，MI值为0.68。基于单独和组合数据集的聚类分析，这16个分类单元被一致地分为两个主要组，这与解剖学结果中的模式相符。总体而言，我们的研究表明，尽管这两种标记系统都能检测到遗传多样性，但SRAP在区分芸香科分类单元方面具有更高的鉴别能力，而SCoT则作为一种补充标记提供了更高的分辨率。通过将解剖学诊断方法与这两种标记类型相结合，为埃及芸香科的分类鉴定、种质资源特征描述及基于标记的保护策略提供了有力的支持。