摘要
羊的养殖为美国提供了稳定且多样化的食品和纤维来源，而日益增长的种族多样性进一步提升了需求。卡塔丁羊是美国培育的一种复合毛型羊种，现已成为该国许多地区最受欢迎的羊种，也是首个在育种计划中应用基因组选择技术的羊种。因此，本研究的主要目的是利用AIREML方法和单步基因组最佳线性无偏预测（ssGBLUP）方法，估算卡塔丁羊在繁殖性状方面的方差成分，包括产羔数（NLB）、断奶羔数（NLW）、首次产羔年龄（AFL）以及从首次到第二次产羔的间隔时间（LI），并确定与这些性状相关的基因组区域和候选基因。研究所用数据集包括127,536只羊的系谱信息、24,067只母羊的56,128次分娩的表型记录，以及经过质量控制后的10,032只羊的基因组数据，共包含30,308个单核苷酸多态性（SNP）。分析工作是使用BLUPF90系列程序完成的。我们发现所有研究对象的遗传力都很低（NLB为0.09?±?0.00，NLW为0.08?±?0.00，AFL为0.09?±?0.01，LI为0.08?±?0.01）。这些性状之间的遗传相关性在0.17?±?0.02（AFL和LI）到0.79?±?0.02（NLB和NLW）之间。所有性状都表现为高度多基因控制，8条染色体（3、6、7、8、9、12、13和15）上的14个显著SNP对性状的总变异度影响较小。这些SNP位于18个候选基因附近或内部：与NLB相关的有4个基因（AAK1、GFPT1、SLC23A2和GDAP1），与NLW相关的有4个基因（ARHGAP18、TTLL2、UNC93A和GPR31），与AFL相关的有6个基因（NAP1L5、FAM13A、HS3ST1、CCDC181、NME7和BLZF1），与LI相关的有4个基因（TAF4、CDH4、CADM1和SEL1L）。这些候选基因此前已被发现与生育能力、胚胎发育、生长、疾病抵抗力和气候适应性性状有关。我们的研究结果表明，通过直接的基因选择可以改善卡塔丁羊的生育能力和繁殖性状。由于能够在更年轻的年龄获得更准确的育种值估计，基因组选择将有助于提升这些性状的遗传改良水平。尽管这些性状受遗传因素和环境因素的复杂相互作用影响，但所识别的候选基因有助于更好地理解卡塔丁羊繁殖性能背后的生物学机制。
利益冲突声明
作者声明没有利益冲突。
数据可用性说明
支持本研究结果的数据可从国家羊业改良计划（NSIP）获取。这些数据的使用受到限制，仅为本研究而依据许可使用。经国家羊业改良计划（NSIP）许可，数据可从作者处获取。
