冰淇淋：高保真度的等变冷冻电子断层扫描技术

《Acta Crystallographica Section D Structural Biology》：ICECREAM: high-fidelity equivariant cryo-electron tomography

　　

摘要

冷冻电子断层扫描（cryo-ET）能够以接近天然状态的方式呈现细胞的三维结构。尽管各种深度学习方法在去噪和伪影校正方面取得了进步，但仍面临信噪比极低、倾斜角度范围受限（“缺失楔形区域”）以及缺乏真实参考数据的问题。在这里，我们介绍了ICECREAM，该算法将早期的自监督方法与最近的等变成像框架[Chen等人（2021年，IEEE/CVF国际计算机视觉会议（ICCV），第4359–4368页）]相结合。在多种实验数据集上，ICECREAM在去噪效果和缺失楔形区域的填充方面均优于现有方法。ICECREAM可以应用于任何能够提供体积两个统计独立视角的断层扫描问题；在冷冻电子断层扫描中，这些视角是通过剂量分割或倾斜序列的角度划分获得的。ICECREAM的源代码可在https://github.com/swing-research/icecream处获取。