摘要692：新型单细胞和批量下一代测序（NGS）检测方法，用于更准确地评估急性髓系白血病（AML）中的可测量残留疾病（MRD）和克隆动态

《Cancer Research》：Abstract 692: Novel single cell and bulk NGS assays for improved assessment of MRD (measurable residual disease) and clonal dynamics in acute myeloid leukemia (AML). Free

急性髓系白血病（AML）微小残留病（MRD）检测及克隆动态分析：比较Tapestri单细胞多组学技术与HemeSTAMP-MRD bulk NGS的临床应用，显示两者较传统流式细胞术（MFC）更敏感，能更好预测复发并识别actionable突变，Tapestri独特优势在于单细胞分辨率追踪克隆演化。

　　

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摘要

背景：

急性髓系白血病（AML）的基因组异质性以及高复发/难治（R/R）率要求我们开发更先进的工具来检测微小残留病（MRD）并研究克隆进化。目前的标准治疗方法（SOC）如多参数流式细胞术（MFC）或单变异分子检测，在灵敏度、适用性以及解析克隆动态方面存在局限性。我们评估了Tapestri单细胞多组学AML检测方法（Mission Bio）和HemeSTAMP-MRD（一种新型高灵敏度批量NGS检测方法），以探索它们作为MRD检测和克隆分析的替代方案。

方法：

我们分析了24名AML患者的72份骨髓或外周血单核细胞样本，这些患者分别处于诊断期（n=18）、缓解期（n=35）或R/R期（n=19）。首先通过CD34+/CD117+富集，使用41基因面板和17个细胞表面标志物面板进行Tapestri单细胞基因型和免疫表型分析。HemeSTAMP-MRD是基于斯坦福大学分子病理学实验室自有的203基因临床NGS面板优化后的生物信息学版本（Kim等人，2022年）。所有样本均在CLIA认证的实验室中进行了检测。每位患者至少有一个可追踪的诊断变异。MRD结果与SOC MFC的结果进行了比较。

结果：

87%（21/24）的患者达到了初始临床缓解（CR1），其中62.5%（15/21）的患者在之后复发。MFC仅在33%（5/15）的CR1期样本中检测到MRD，而Tapestri和HemeSTAMP分别在67%（10/15）的样本中检测到MRD，其中8例患者的检测结果一致。在MFC检测阴性的样本中（n=10/15），有4例通过Tapestri和/或HemeSTAMP检测到MRD，其变异等位基因频率低于1%，其中包括一名携带可治疗IDH2突变的患者，该患者在接受靶向治疗前复发并死亡。尽管所有检测方法均显示MRD阴性，但仍有3名患者复发，这些患者要么仅发生髓外复发，要么在复发前失去了可追踪的变异，要么采样不足。在尚未复发的患者中，Tapestri和HemeSTAMP-MRD在6名患者的CR1期间检测到了残留变异，尽管其中4名患者后来接受了异基因移植。在活动性疾病期（诊断或R/R阶段），Tapestri平均每个样本检测到4个克隆（范围1-9个）。在配对样本中，88%（8/9）的患者在诊断和R/R期间出现了克隆进化：37.5%（3/8）的患者出现了新的克隆，62.5%（5/8）的患者失去了原有的克隆。最具动态性的基因是NRAS、NF1、PTPN11和TET2，而TP53和DNMT3A则相对稳定。

结论：

Tapestri和HemeSTAMP-MRD在MRD检测、复发预测以及识别可治疗突变方面均优于MFC，其中Tapestri能够实现单细胞水平的克隆动态解析，有助于探究R/R疾病的驱动因素。更大规模的队列验证正在进行中。

引用格式：

Crystal Zhou, Ruwan Gunaratne, Emily Yang, Rachel Agoglia, Diwash Jangam, Charu Tiwari, Kailee Tanaka, Tsoyu Chiang, Chandler Ho, Sydney Lu, James L. Zehnder, Bing Melody Zhang, Henning Stehr, Tian Yi Zhang. 新型单细胞和批量NGS检测方法在急性髓系白血病（AML）中用于改善MRD（可测量残留病）和克隆动态的评估 [摘要]。载于：2026年美国癌症研究协会年会论文集；第一部分（常规摘要）；2026年4月17-22日；加利福尼亚州圣地亚哥。费城：AACR；Cancer Res 2026;86(7 Suppl):Abstract nr 692。