基于荧光SSR技术的DNA指纹分析及69份普通话资源的分子身份卡构建 吴晓晓、 吴世满、 方海蒙、 黄丁、 陈传武、 娄冰海、 刘萍、 唐阳、 冯静、 邓崇玲

《Horticulturae》：Fluorescent SSR-Based DNA Fingerprinting and Molecular Identity Card Development for 69 Mandarin Accessions Xiaoxiao Wu, Shiman Wu, Haimeng Fang, Ding Huang, Chuanwu Chen, Binghai Lou, Ping Liu, Yang Tang, Jing Feng and Chongling Deng

　　

摘要

为了建立标准化的大柑橘类植物DNA指纹图谱和分子鉴定系统，我们通过荧光SSR毛细管电泳技术分析了69份大柑橘样本，构建了它们的DNA分子指纹图谱和独特的分子身份标识。筛选出了18对高多态性的SSR引物对，共获得了239个基因型信息和147个等位基因。每对引物扩增的等位基因数量范围为4到18个，多态性信息含量（PIC）值介于0.411到0.650之间。进一步选择了10对核心引物对，其区分率为65.2%（在69份样本中区分出了45份）。利用这些荧光SSR标记，我们为所有69份样本建立了DNA分子指纹图谱和独特的分子身份标识。其中，45份样本具有独特的指纹图谱，而其余24份无法区分的样本被分为6组。每组中既包含野生资源（共4份）也包含栽培资源（共20份），且这些资源具有较高的遗传相似性，值得进一步研究。本研究为大柑橘种质资源的鉴定、保存和遗传关系分析提供了实用的基础，并为标准化大柑橘品种鉴定建立了技术框架。