通过RNA测序技术，研究了Arbor Acres肉鸡和陶源鸡在胚胎发育过程中肌肉的动态变化

《BMC Genomics》：Dynamic development of muscle during embryogenesis in Arbor Acres broilers and TaoYuan chickens revealed by RNA sequencing

　　

摘要

背景

胚胎肌肉发育是一个高度动态且复杂的过程，由众多基因和转录调控因子（如小RNA）共同协调。

结果

本研究分析了Arbor Acres（AA）肉鸡和TaoYuan（TY）鸡在三个胚胎时期（E9、E13和E18）的胸肌转录组动态。虽然两种品种中发育调控基因富集的生物学途径相似，但microRNA（miRNA）-mRNA相互作用网络的结构存在差异。通过结合加权基因共表达网络分析、差异表达分析和时间序列聚类分析，我们鉴定出了161个候选基因，其中39个基因的表达呈逐渐下降趋势。miRNA的差异表达分析显示，gga-miR-1744-3p在TY鸡的E13和E18阶段显著上调。通过整合TargetScan和miRDB的预测结果，我们进一步确定了这39个候选基因中的两个核心基因（USP8和ZBTB38），它们被认为是gga-miR-1744-3p的靶基因。这两个基因在心脏、胸肌和脂肪组织中表现出差异表达，并且在TY鸡中的表达水平显著更高。功能实验证实，gga-miR-1744-3p能够促进鸡原代肌细胞的增殖。

结论

本研究全面了解了肉鸡在胚胎发育过程中胸肌的发育模式和分子机制。