糖核苷酸的多羟基吡咯烷基类似物的合成:研究其与GalNAC-T相互作用的实验和计算方法

《ChemBioChem》:Synthesis of Polyhydroxylated Pyrrolidinyl Analogs of Sugar Nucleotides. Experimental and Computational Studies on Their Interactions With GalNAC-T's

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年04月14日 来源:ChemBioChem 2.8

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   >( 摘要 多羟基吡咯烷基β-氨基膦酸与尿苷一磷酸(UMP)的直接结合生成了多羟基吡咯烷基糖核苷酸类似物,这些类似物可作为N-乙酰半乳糖转移酶的优良抑制剂。通过将膦酸加入

  
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摘要

多羟基吡咯烷基β-氨基膦酸与尿苷一磷酸(UMP)的直接结合生成了多羟基吡咯烷基糖核苷酸类似物,这些类似物可作为N-乙酰半乳糖转移酶的优良抑制剂。通过将膦酸加入多羟基环状硝酮中,成功合成了具有对映体纯度的β-氨基膦酸。该反应经过了详细研究,获得了优异的非对映选择性,这一结果与密度泛函理论计算结果高度一致。通过实验和分子动力学模拟,研究了这些核苷酸类似物与N-乙酰半乳糖转移酶(GalNAc-T2、GalNAc-T14和GalNAc-T16)的结合情况。饱和转移差异核磁共振实验及Kd值的测量用于验证活性位点的结合模型。这些研究为理解焦磷酸基团和吡咯烷基团对酶亲和力的影响提供了重要信息。

图表摘要

采用基于有机合成的多学科方法,结合量子力学计算、高效的磷酸化技术、常规亲和力研究以及饱和转移差异核磁共振技术,并通过分子动力学模拟,成功制备了对GalNAc-Ts家族酶具有亲和力的核苷酸类似物。

利益冲突

作者声明不存在利益冲突。

数据可用性声明

本研究的支持数据可在本文的补充材料中找到。

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