宏基因组分析利用纳米孔测序技术揭示了从中印度野外采集的伊蚊幼虫中所包含的病毒多样性

《Scientific Reports》：Metagenomic profiling unveils the viral diversity in field-collected Aedes larvae from Central India employing nanopore sequencing

　　

摘要

在过去的二十年里，包括登革热、基孔肯雅热、寨卡病毒、西尼罗河病毒和日本脑炎病毒在内的多种虫媒病毒在世界各地不断出现和重新出现。因此，利用最先进的下一代测序技术对这类病毒进行环境监测，可以帮助我们更好地了解可能发生的疫情，从而及时采取干预措施。在本研究中，研究人员从印度中部瓜廖尔的不同地点收集了Aedes（伊蚊）幼虫，将其培养至成年阶段，并通过Oxford Nanopore平台进行宏基因组分析。分析结果揭示了这些蚊子所携带的病毒组的多样性。研究发现，与Myoviridae、Mimiviridae、Iridoviridae、Bunyaviridae、Flaviviridae、Mesonivirdae等病毒科相关的病毒在这些蚊子中普遍存在，但相对丰度各不相同。其中Betabaculovirus、Mimivirus和Shamonda病毒在多数样本中的丰度较高。此外，还发现了Phasi Charoen-like病毒（PCLV）、Nam Dinh病毒（NDiV）、Hubei mosquito病毒（HMV）以及Wenzhou sobemo-like病毒4型（WSLV）等病毒。这项工作首次成功地对来自印度中部瓜廖尔的野外采集的蚊子进行了宏基因组分析。未来，这种技术可以广泛应用于野外蚊子的研究，有助于提高公众对当前流行病毒的认识，为应对可能的未来疫情做好准备。