去铁酮的溶解度研究:从热力学框架到机器学习方法

《Fluid Phase Equilibria》:Deferiprone Solubility: From Thermodynamic Frameworks to Machine Learning Approaches

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年04月30日 来源:Fluid Phase Equilibria 2.7

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  作者:Sina Pakkhesal、Dmitriy M. Makarov、Jonas Habicht、Gabriele Sadowski、Abolghasem Jouyban机构:伊朗大不里士医科大学药学科学研究所药物分析研究中心摘要本研究开发并验证了一些计算模型,用于预测去铁酮

  
作者:Sina Pakkhesal、Dmitriy M. Makarov、Jonas Habicht、Gabriele Sadowski、Abolghasem Jouyban
机构:伊朗大不里士医科大学药学科学研究所药物分析研究中心

摘要

本研究开发并验证了一些计算模型,用于预测去铁酮(一种重要的铁螯合药物)在单一溶剂系统和混合溶剂系统中在不同温度下的溶解度。我们从文献中整理出了一套全面的实验测定溶解度数据。采用多元线性回归分析方法,分别单独以及结合使用Abraham、Hansen、Catalán和Laurence溶剂参数,在van’t Hoff方程的框架内训练模型。最终得到的综合模型能够很好地解释溶解度变化,其整体平均相对偏差(MRD)为7.9%。基于Hildebrand溶解度方法的简化模型,仅使用每个溶剂的单个实验数据点进行训练,其溶解度相关性的MRD约为15.0%。同样,扰链统计缔合流体理论(PC-SAFT)也仅利用每个溶剂的单个数据点,成功预测了去铁酮的溶解度,其MRD约为14.2%。去铁酮的PC-SAFT相关参数是通过先前开发的机器学习方法预测得到的。此外,还测试了CatBoost和XGBoost等机器学习模型直接预测去铁酮溶解度的能力,其中CatBoost模型在交叉验证下的MRD为8.9%。
对于混合溶剂系统,通过结合各溶剂的物理化学参数扩展了Jouyban-Acree模型。该模型包含了所有四种类型的参数(即Hansen、Abraham、Catalán和Laurence参数),能够很好地解释去铁酮在混合溶剂中的溶解度变化,其整体MRD为6.5%;而基于所有去铁酮溶解度数据训练的CatBoost模型的MRD为9.6%。即使不使用任何混合溶剂中的去铁酮溶解度数据,PC-SAFT也能完全预测这些数据,其整体MRD为27.1%。在药物开发的早期阶段,仅需很少的实验输入数据(溶质的熔化性质以及每个溶剂的一个溶解度数据点),就可以使用PC-SAFT对单一溶剂和混合溶剂进行建模。所提供的相关模型仅适用于去铁酮的溶解度数据,但一旦有足够大的实验数据库,这些模型也可以用于其他药物。

引言

在药学科学、化学工程和材料科学领域,精确预测单一溶剂系统和混合溶剂系统中的溶解度是一个关键的研究方向。溶解度是一个基本性质,直接影响着药物配方、结晶、分离和纯化等多个过程。从药学的角度来看,溶解度对于确定活性药物成分的生物利用度和治疗效果至关重要[[1], [2], [3]]。由于实验测定溶解度通常耗时且资源密集,因此开发准确可靠的计算模型来进行溶解度预测具有重要意义。这类模型能够高效地理解溶质-溶剂相互作用,并在最小依赖实验数据的情况下优化溶剂系统[[4]]。
准确预测溶解度这一基本热力学性质一直是广泛研究的主题,这促进了多种计算和理论方法的发展。早期的研究集中在经验性和半经验性方法上,虽然预测能力有限,但仍具有一定的实用性[[5], [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14]]。高级方法如扰链统计缔合流体理论(PC-SAFT)通过纳入分子大小、形状和缔合效应,进一步提高了预测准确性,使得在复杂溶剂系统中能够以最少的实验输入实现溶解度的相关性和预测[[15]]。
当前的研究越来越多地利用数据驱动和统计上复杂的技术。定量结构-活性/性质关系(QSAR/QSPR)[[16], [17], [18]]以及机器学习(ML)算法[[14,19]](包括支持向量机、随机森林和人工神经网络)通过建立分子结构(通过多种描述符编码)与观察到的溶解度之间的稳健相关性来构建预测模型。数据可用性的最新进展,特别是大规模数据集,推动了能够分析复杂化学数据并预测结果的复杂模型的发展。例如,深度学习方法(如神经网络)在准确评估化合物溶解度方面表现出色,Cui等人的深度学习模型就成功预测了新型化合物的水溶性[[21]]。Transformer架构和双向LSTM也被用于分析SMILES字符串以预测溶解度,其性能优于传统方法[[22,23]]。此外,对图神经网络、随机森林以及LightGBM和XGBoost等集成方法的比较分析突显了这些技术在解决各种应用中的溶解度挑战时的多功能性,进一步强调了它们在工业和研究领域的重要性[[24], [25], [26], [27], [28]]。
Jouyban-Acree模型[[29]]提供了一个强大的框架,特别适合分析和预测混合溶剂系统中的溶解度。该模型巧妙地结合了纯组分溶剂中的溶解度与相互作用项,从而能够准确表示并通常可靠地预测溶解度,同时考虑了溶剂组成和温度的影响。当有纯溶剂中的实验溶解度数据时,Jouyban-Acree模型的实用性尤为明显,它有助于插值,并通过适当的验证进行外推,以预测复杂多组分溶剂混合物中的行为。这些数据驱动且数学上严谨的方法在应对复杂化学系统带来的挑战以及日益增长的实验数据量方面变得越来越不可或缺。
去铁酮(3-羟基-1,2-二甲基吡啶-4(1H)-酮)是一种重要的药物化合物,作为一种双齿口服铁螯合剂(图1)。它主要用于治疗铁过载疾病,如重型地中海贫血患者和其他依赖输血的贫血症[[30]]。去铁酮与铁离子结合形成稳定的3:1复合物,有助于将多余的铁排出体外[[31]]。与其他药物化合物一样,去铁酮的溶解度直接影响其生物利用度、稳定性和制剂形式。此外,去铁酮在二元溶剂系统中的溶解度尤为重要,因为这些系统常用于药物制剂中以提高溶解度并确保药物稳定性[[32]]。
多项先前的研究记录了去铁酮在以下单一溶剂中的溶解度和热力学性质:1,4-二氧环烷、2-丙醇、乙腈、氯仿、二氯甲烷、乙醇、乙酸乙酯、乙二醇、甲醇、N-甲基吡咯烷酮(NMP)、聚乙二醇400(PEG 400)、1-丙醇、丙二醇和水,以及混合溶剂(乙醇+乙腈、乙酸乙酯)、乙二醇+(乙醇、NMP、PEG 400、丙二醇)、NMP+乙醇、PEG 400+(1-丙醇、2-丙醇)、2-丙醇+水、丙二醇+(乙醇、1-丙醇、2-丙醇)和水+(乙醇、乙二醇、NMP、PEG 400、丙二醇)[[33], [34], [35], [36], [37], [38], [39], [40], [41], [42], [43], [44], [45]]。
开发新的计算模型来预测化合物在单一溶剂系统和混合溶剂系统中的溶解度,为利用实验溶解度数据构建考虑关键物理化学参数的预测框架提供了机会。在本研究中,我们利用了大量先前报道的去铁酮溶解度数据,并结合了多种溶剂色度参数和跨框架建模方法,提出了一些计算方法,用于关联去铁酮在不同温度下的溶解度。

节选内容

数据采集

为了收集相关的实验数据,我们使用了Scopus和PubMed数据库进行了全面的文献搜索。同时采用了手工搜索策略,以识别报道去铁酮在各种溶剂中溶解度的同行评审文章。搜索范围限于英文发表的文章,并且包含实验溶解度数据。提取的数据包括溶解度值、溶剂类型、温度条件和其他相关实验参数。

结果与讨论

根据搜索结果,有13篇文章符合纳入标准并被纳入本研究。去铁酮在单一溶剂和混合溶剂中的溶解度数据以及所使用的溶质和溶剂参数分别列在补充表S4-S6中。

结论

本研究成功开发并验证了用于预测去铁酮在单一溶剂系统和混合溶剂系统中溶解度的新计算模型。将Abraham、Hansen、Catalán和Laurence溶剂参数整合到van’t Hoff和Jouyban-Acree框架中,显著提高了相关性的预测准确性,优于仅使用单一参数集的模型。这些组合模型的卓越性能强调了...

CRediT作者贡献声明

Sina Pakkhesal:撰写原始稿件、进行研究、数据整理。Dmitriy M. Makarov:撰写原始稿件、进行研究、进行形式分析、概念化。Jonas Habicht:撰写原始稿件、开发软件、进行研究、进行形式分析。Gabriele Sadowski:撰写原始稿件、提供监督。Abolghasem Jouyban:撰写原始稿件、进行验证、提供监督、进行研究、进行形式分析、进行概念化。
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