告别 FFPE 提取瓶颈,Covaris 产出测序级核酸

【字体: 时间:2026年04月24日 来源:基因有限公司

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  基因有限公司代理的Covaris 基于自适应聚焦声波(AFA®)技术开发truXTRAC FFPE 提取方法及其试剂盒。可实现对一个样本同时提取DNA和RNA,为您提供全新的FFPE核酸提取解决方案!

FFPE 样本是肿瘤临床诊断的核心金标准,却长期被核酸提取难题困扰 —— 降解严重、回收率低、完整性差,直接制约测序质量与临床精准度。

基因有限公司代理的Covaris 基于自适应聚焦声波(AFA®)技术开发truXTRAC FFPE 提取方法及其试剂盒。可实现对一个样本同时提取DNA和RNA,为您提供全新的FFPE核酸提取解决方案!完美助力二代,三代测序,为肿瘤精准诊断与测序技术筑牢关键第一步。

Part 1  AFA聚焦超声-脱蜡彻底

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Part 2  实验流程快速高效-DNA/RNA 共提  

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truTRAC FFPE total NA kit试剂盒

▪  更安全:告别二甲苯等有机溶剂

▪  更高的核酸得率和质量:满足测序需求

▪  更高效率: 可同时抽提DNA和RNA

▪  更高的样本容量:可处理5-25um厚FFPE组织切片

▪  通量更灵活:纯化可选柱纯化和自动磁珠富集,有自动化试剂盒

▪  核酸提取到片段化全程单管操作:衔接NGS片段化,减少污染

▪  满足更多实验需求: NGS片段化、长片段DNA提取及基因组DNA提取三种程序选择,满足NGS、qPCR、芯片、三代测序等不同实验需求。

▪  适配仪器:Covaris仪器LE220-plus, LE220R-plus, ME220, E220, E220evo, M220, S220

Part 3  更高的核酸质量-测序数据展示

1 更适合NGS

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用illumina FFPE QC kit 分别检验 Covaris truXTRAC® 和Q厂家FFPE试剂盒提取的4种不同组织的DNA。所有Covaris处理的样品A Cq 值 均低于2,可以用于Truseg文库构建。(ΔCq 值越低核酸质量越高,越适合NGS)。

2 测序覆盖度更均一

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FFPE样本与新鲜样本提取DNA测序覆盖度比较:其中横坐标表示染色体,深色为覆盖度大于10x的区域,Covaris truXTRAC®提取的样本,覆盖更加均匀,更接近新鲜的冰冻样本。

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使用Covaris truXTRAC试剂提取的样本,测序覆盖的均一度更接近于新鲜的冰冻样本。

3 更高的RNA DV200值

illumina 推荐用大于200nt RNA片段所占比值即DV200值来评估用于illumina文库构建的RNA样本质量,DV200值小于30%的样本不推荐用于文库构建,随着DV200值越高,RNA input量可以减少。从下图可以看出,使用Covaris 提取的FFPE样本RNA DV200值均符合建库要求。

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Part 4  主流平台推荐

主流测序平台如三代单分子测序PACB10、ilumina旗下Epicentre(现Lucigen)等在处理FFPE样本时,均推荐Covaris truXTRAC FFPE核酸提取。

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近年来引用文献不断增加中

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