通过传统培养和高通量测序技术对健康个体皮肤细菌的比较分析

《Scientific Reports》：A comparative analysis of skin bacteria in healthy individuals through traditional cultivation and high-throughput sequencing techniques

　　

摘要

人体皮肤微生物群与其所处的微环境有着密切的联系。由于不同皮肤区域的微环境各不相同，这些区域可能孕育着不同的细菌群落结构。为了阐明皮肤细菌群落的区域特异性分布模式，本研究采用了一种综合方法，结合了传统的微生物培养技术和16S rRNA基因的高通量测序技术，分析了来自35名健康个体的额头、前臂掌侧和头皮的105份皮肤拭子样本。通过传统培养方法共分离出675株细菌，涵盖41个物种和18个属。葡萄球菌属（Staphylococcus）和库蒂巴克特菌属（Cutibacterium）是不同皮肤区域中的优势属，其中头葡萄球菌（S. capitis）、表皮葡萄球菌（S. epidermidis）、人葡萄球菌（S. hominis）和痤疮丙酸杆菌（C. acnes）是主要存在的物种。高通量测序分析显示，额头和前臂的微生物群落特征相似，而头皮的细菌群落则具有更明显的差异，表现为α多样性较低，以及库蒂巴克特菌属、葡萄球菌属和劳森菌属的相对丰度较高。传统培养方法和高通量测序的结果均表明，人体皮肤细菌群落具有很强的区域特异性。与不同皮肤区域之间的显著差异相比，性别和年龄对微生物群落组成的影响较小。这些结果表明，在塑造人体皮肤微生物群的多样性和群落结构方面，微环境因素的作用比年龄和性别相关因素更为重要。