RNA-seq技术揭示了黄珊瑚（Porites lutea）中“谁在做什么”

《Microbiome》：RNA-seq sheds light on “who is doing what” in the coral Porites lutea

　　

摘要

背景

珊瑚整体生物群作为一个复杂的生物地球化学系统运作，其运作依赖于宿主与其相关微生物组之间的复杂代谢交换。尽管这些微生物群落的分类多样性已有充分记录，但不同珊瑚结构（尤其是内生栖息地中的微生物）的具体代谢作用和生物地球化学贡献仍知之甚少。我们利用RNA测序技术研究了健康石珊瑚Porites lutea的活跃微生物组，重点研究了珊瑚组织、绿色内生藻类层（Ostreobium层）以及更深的珊瑚骨骼。

结果

我们在这些结构中发现了不同的、具有代谢活性的微生物群落，并发现碳、氮和硫代谢途径存在显著的冗余性。我们的研究首次提供了转录组证据，证明Ostreobium能够将固定碳传递给其他整体生物群成员和珊瑚宿主。我们强调了多样化的珊瑚整体生物群成员在养分循环和通过清除活性氧及氮物质来维持稳态方面的关键作用。

结论

这项研究从分子层面揭示了不同珊瑚整体生物群成员在其各自结构中的功能作用，强调了珊瑚携带具有广泛功能的独特微生物组。

视频摘要

背景

珊瑚整体生物群作为一个复杂的生物地球化学系统运作，其运作依赖于宿主与其相关微生物组之间的复杂代谢交换。尽管这些微生物群落的分类多样性已有充分记录，但不同珊瑚结构（尤其是内生栖息地中的微生物）的具体代谢作用和生物地球化学贡献仍知之甚少。我们利用RNA测序技术研究了健康石珊瑚Porites lutea的活跃微生物组，重点研究了珊瑚组织、绿色内生藻类层（Ostreobium层）以及更深的珊瑚骨骼。

结果

我们在这些结构中发现了不同的、具有代谢活性的微生物群落，并发现碳、氮和硫代谢途径存在显著的冗余性。我们的研究首次提供了转录组证据，证明Ostreobium能够将固定碳传递给其他整体生物群成员和珊瑚宿主。我们强调了多样化的珊瑚整体生物群成员在养分循环和通过清除活性氧及氮物质来维持稳态方面的关键作用。

结论

这项研究从分子层面揭示了不同珊瑚整体生物群成员在其各自结构中的功能作用，强调了珊瑚携带具有广泛功能的独特微生物组。

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