通过下一代测序技术揭示的泰国黑色素瘤的基因组特征及治疗靶点

《Scientific Reports》：Genomic profiling and therapeutic targets of Thai melanoma revealed by next-generation sequencing

　　

摘要

基因突变是黑色素瘤治疗的关键靶点，但不同种族群体的基因组特征存在差异，在泰国患者中这些特征仍不十分明确。我们利用包含501个基因的OCA-Plus检测 panel结合下一代测序技术，对33个黑色素瘤样本（13例皮肤型、13例肢端型、7例黏膜型）进行了体细胞突变分析，并整合了临床和基因组信息。分析结果显示，BRAF基因是突变频率最高的基因，主要表现为V600E变异；其次是KIT基因。这两种基因均 merupakan 黑色素瘤的重要驱动因素，并且存在互斥关系，其中BRAF突变主要出现在皮肤型黑色素瘤中。由于样本量有限且存在异质性，跨种族比较主要突变驱动因素未发现统计学上的显著差异，因此需要进一步的大规模验证。RAS-MAPK和NOTCH致癌信号通路中的突变最为常见，同时观察到MYC和细胞周期通路中也存在共现的基因改变。在48.5%的患者中检测到具有临床意义的突变变异，其中以BRAF、KIT和NRAS基因的突变最为常见，且主要发生在皮肤型黑色素瘤中。值得注意的是，携带KIT突变的患者无疾病生存期较短，这表明该突变可能具有预测患者预后的作用，值得进一步研究。这些发现为了解泰国黑色素瘤的基因组特征提供了初步依据，并为未来的精准肿瘤学研究指出了潜在的 actionable （可干预的）突变靶点。